Pytania otagowane jako multiple-comparisons

Sygnalizuje sytuacje, w których obawia się osiągnięcia zamierzonej mocy i wielkości, gdy wykonuje się więcej niż jeden test hipotez.

3
Dlaczego od samego początku nie stosuje się wielu poprawek hipotez we wszystkich eksperymentach?
Wiemy, że musimy zastosować korekty podobne do Benjaminiego Hochberga do testowania wielu hipotez w eksperymentach opartych na jednym zestawie danych, w celu kontroli częstotliwości fałszywych odkryć, w przeciwnym razie wszystkie eksperymenty, które dadzą pozytywny wynik, mogą być fałszywe. Ale dlaczego nie stosujemy tej samej zasady do wszystkich eksperymentów od samego …
4
Korekta wartości p dla wielu testów, w których testy są skorelowane (genetyka)
Mam wartości p z wielu testów i chciałbym wiedzieć, czy rzeczywiście jest coś znaczącego po poprawieniu wielu testów. Komplikacja: moje testy nie są niezależne. Metoda, o której myślę (wariant metody produktu Fishera, Zaykin i wsp., Genet Epidemiol , 2002) wymaga korelacji między wartościami p. Aby oszacować tę korelację, obecnie myślę …
7
Co jest złego w dostosowaniach Bonferroni?
Czytam następujący artykuł: Perneger (1998) Co jest nie tak z korektami Bonferroniego . Autor podsumował stwierdzeniem, że dostosowanie Bonferroniego ma w najlepszym wypadku ograniczone zastosowania w badaniach biomedycznych i nie powinno się go stosować przy ocenie dowodów dotyczących konkretnej hipotezy: Punkty podsumowujące: Dostosowanie istotności statystycznej do liczby testów wykonanych na …
4
Czy istnieje nieparametryczny odpowiednik Tukey HSD?
Używam JMP do badania różnic w pokryciu wegetacyjnym w grupach form wzrostu (drzewa, krzewy, zioła itp.) Przed i po trzech zabiegach kontrolnych. Rozmiar mojej próbki jest niewielki (n = 5) i większość moich rozkładów zwykle nie jest dystrybuowana. W przypadku rozkładów normalnych użyłem ANOVA do analizy różnic (zmiana procentowa) między …
4
Metoda Z-score Stouffera: co jeśli sumujemy zamiast ?
Przeprowadzam niezależnych testów statystycznych z tą samą hipotezą zerową i chciałbym połączyć wyniki w jedną wartość . Wydaje się, że istnieją dwie „akceptowane” metody: metoda Fishera i metoda Stouffera .NNNppp Moje pytanie dotyczy metody Stouffera. Dla każdego osobnego testu otrzymuję wynik Z- ziziz_i . Zgodnie z hipotezą zerową, a każdy …
3
Jak i kiedy korzystać z dopasowania Bonferroni
Mam dwa pytania dotyczące tego, kiedy użyć korekty Bonferroni: Czy właściwe jest zastosowanie korekty Bonferroni we wszystkich przypadkach wielokrotnego testowania? Jeśli ktoś przeprowadza test na zestawie danych, dzieli go na dokładniejsze poziomy (np. Dzieli dane według płci) i wykonuje te same testy, jak to może wpłynąć na liczbę postrzeganych testów …
4
Jak rzutować nowy wektor na przestrzeń PCA?
Po przeprowadzeniu analizy głównego składnika (PCA) chcę rzutować nowy wektor na przestrzeń PCA (tzn. Znaleźć jego współrzędne w układzie współrzędnych PCA). Mam obliczony PCA w języku R użyciu prcomp. Teraz powinienem być w stanie pomnożyć mój wektor przez macierz obrotu PCA. Czy główne elementy tej macierzy powinny być ułożone w …
21 r  pca  r  variance  heteroscedasticity  misspecification  distributions  time-series  data-visualization  modeling  histogram  kolmogorov-smirnov  negative-binomial  likelihood-ratio  econometrics  panel-data  categorical-data  scales  survey  distributions  pdf  histogram  correlation  algorithms  r  gpu  parallel-computing  approximation  mean  median  references  sample-size  normality-assumption  central-limit-theorem  rule-of-thumb  confidence-interval  estimation  mixed-model  psychometrics  random-effects-model  hypothesis-testing  sample-size  dataset  large-data  regression  standard-deviation  variance  approximation  hypothesis-testing  variance  central-limit-theorem  kernel-trick  kernel-smoothing  error  sampling  hypothesis-testing  normality-assumption  philosophical  confidence-interval  modeling  model-selection  experiment-design  hypothesis-testing  statistical-significance  power  asymptotics  information-retrieval  anova  multiple-comparisons  ancova  classification  clustering  factor-analysis  psychometrics  r  sampling  expectation-maximization  markov-process  r  data-visualization  correlation  regression  statistical-significance  degrees-of-freedom  experiment-design  r  regression  curve-fitting  change-point  loess  machine-learning  classification  self-study  monte-carlo  markov-process  references  mathematical-statistics  data-visualization  python  cart  boosting  regression  classification  robust  cart  survey  binomial  psychometrics  likert  psychology  asymptotics  multinomial 
4
Jeśli planowanych jest wiele porównań, czy nadal trzeba korygować wiele porównań?
Recenzuję artykuł, który wykonał> 15 osobnych testów 2x2 Chi Square. Zasugerowałem, że muszą poprawić wiele porównań, ale odpowiedzieli, mówiąc, że wszystkie porównania zostały zaplanowane i dlatego nie jest to konieczne. Wydaje mi się, że to nie musi być poprawne, ale nie mogę znaleźć żadnych zasobów, które wyraźnie stwierdzą, czy tak …
5
Kiedy można użyć kryteriów opartych na danych, aby określić model regresji?
Słyszałem, że gdy wiele specyfikacji modelu regresji (powiedzmy w OLS) jest rozważanych jako możliwości zestawu danych, powoduje to wiele problemów z porównaniem, a wartości p i przedziały ufności nie są już wiarygodne. Jednym z ekstremalnych przykładów jest regresja stopniowa. Kiedy mogę użyć samych danych, aby pomóc w określeniu modelu, a …
5
Post-hocs dla testów przedmiotowych?
Jaka jest preferowana metoda przeprowadzania post-hoców w ramach testów przedmiotowych? Widziałem opublikowane prace, w których stosuje się HSD Tukeya, ale przegląd Keppela i Maxwella i Delaneya sugeruje, że prawdopodobne naruszenie kulistości w tych projektach powoduje, że termin błędu jest niepoprawny, a takie podejście jest problematyczne. Maxwell i Delaney podają podejście …
3
Zamieszanie z częstością fałszywych odkryć i wielokrotnymi testami (na Colquhoun 2014)
Przeczytałem ten wielki artykuł Davida Colquhouna: Badanie współczynnika fałszywych odkryć i błędnej interpretacji wartości p (2014). Zasadniczo wyjaśnia, dlaczego współczynnik fałszywych odkryć (FDR) może wynosić nawet chociaż kontrolujemy błąd typu I za pomocą .30%30%30\%α=0.05α=0.05\alpha=0.05 Nadal jednak nie jestem pewien, co się stanie, jeśli zastosuję kontrolę FDR w przypadku wielokrotnych testów. …
1
Czy poprawka Benjaminiego-Hochberga jest bardziej konserwatywna w miarę wzrostu liczby porównań?
Jak konserwatywna jest poprawka wielokrotnego testowania Benjaminiego-Hochberga w stosunku do całkowitej liczby porównań? Na przykład, jeśli mam listę 18 000 funkcji dla dwóch grup i wykonuję test Wilcoxona, aby uzyskać wartość p. Dostosowuję tę wartość p za pomocą Benjamini-Hochberg i prawie nic nie jest tak znaczące. Wiem, że korekcja Bonferroniego …
3
Czy ktoś rozwiązał ćwiczenie PTLOS 4.1?
To ćwiczenie podane w Teorii Prawdopodobieństwa: Logika Nauki Edwin Jaynesa 2003. Jest to częściowe rozwiązanie tutaj . Opracowałem bardziej ogólne częściowe rozwiązanie i zastanawiałem się, czy ktoś go rozwiązał. Poczekam chwilę, zanim opublikuję swoją odpowiedź, aby dać innym szansę. Okej, więc załóżmy, że mamy wzajemnie wykluczającą się i wyczerpującą hipotezę, …
Korzystając z naszej strony potwierdzasz, że przeczytałeś(-aś) i rozumiesz nasze zasady używania plików cookie i zasady ochrony prywatności.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.