Jak i kiedy korzystać z dopasowania Bonferroni


21

Mam dwa pytania dotyczące tego, kiedy użyć korekty Bonferroni:

  • Czy właściwe jest zastosowanie korekty Bonferroni we wszystkich przypadkach wielokrotnego testowania?
  • Jeśli ktoś przeprowadza test na zestawie danych, dzieli go na dokładniejsze poziomy (np. Dzieli dane według płci) i wykonuje te same testy, jak to może wpłynąć na liczbę postrzeganych testów indywidualnych? Oznacza to, że jeśli hipotezy X zostaną przetestowane na zbiorze danych zawierającym dane zarówno od mężczyzn, jak i kobiet, a następnie zestaw danych zostanie podzielony, aby dać osobne dane mężczyznom i kobietom oraz te same testowane hipotezy, czy liczba pojedynczych hipotez pozostanie jako X lub wzrośnie z powodu dodatkowe testy?

Dziękuję za twoje komentarze.

Odpowiedzi:


14

Korekta Bonferroni zawsze zapewni silną kontrolę rodzinnego wskaźnika błędów. Oznacza to, że bez względu na charakter i liczbę testów lub relacje między nimi, jeśli ich założenia zostaną spełnione, zapewni, że prawdopodobieństwo uzyskania choć jednego błędnego znaczącego wyniku wśród wszystkich testów będzie co najwyżej , twój pierwotny poziom błędu . Dlatego jest zawsze dostępny .α

To, czy stosowne jest jego użycie (w przeciwieństwie do innej metody, czy też może w ogóle brak korekty) zależy od twoich celów, standardów dyscypliny i dostępności lepszych metod dla twojej konkretnej sytuacji. Przynajmniej powinieneś prawdopodobnie rozważyć metodę Holma-Bonferroniego, która jest równie ogólna, ale mniej konserwatywna.

Jeśli chodzi o swój przykład, ponieważ wykonują szereg testów, to jest zwiększenie poziomu błędów rodzinny mądry (prawdopodobieństwo odrzucenia co najmniej jednej hipotezy zerowej błędnie). Jeśli wykonasz tylko jeden test na każdej połowie, możliwe będzie wiele korekt, w tym metoda Hommela lub metody kontrolujące współczynnik fałszywych wykrytych błędów (który różni się od rodzinnego wskaźnika błędów). Jeśli przeprowadzisz test na całym zestawie danych, a następnie kilka podtestów, testy nie będą już niezależne, więc niektóre metody nie są już odpowiednie. Jak powiedziałem wcześniej, Bonferroni jest zawsze dostępny i gwarantuje działanie zgodne z reklamą (ale także bardzo konserwatywny…).

Możesz również zignorować cały problem. Formalnie poziom błędu dla całej rodziny jest wyższy, ale przy zaledwie dwóch testach nadal nie jest tak źle. Możesz także rozpocząć od testu całego zestawu danych, traktowanego jako główny wynik, a następnie podtestów dla różnych grup, nieskorygowanych, ponieważ są one rozumiane jako wyniki wtórne lub dodatkowe hipotezy.

Jeśli weźmiesz pod uwagę wiele zmiennych demograficznych w ten sposób (w przeciwieństwie do zwykłego testowania różnic płci od samego początku lub być może bardziej systematycznego modelowania), problem staje się poważniejszy ze znacznym ryzykiem „pogłębiania danych” (jedna różnica okazuje się znaczący przez przypadek, umożliwiając uratowanie niejednoznacznego eksperymentu z ładną historią o zmiennej demograficznej do uruchomienia, podczas gdy tak naprawdę nic się nie wydarzyło) i zdecydowanie powinieneś rozważyć jakąś formę dostosowania do wielokrotnych testów. Logika pozostaje taka sama w przypadku X różnych hipotez (dwukrotne testowanie hipotez X - po jednej na każdą połowę zestawu danych - pociąga za sobą wyższy poziom błędu rodzinnego niż testowanie hipotez X tylko raz i prawdopodobnie należy to dostosować).


1
Należy zauważyć, że w przypadku zmiennych dyskretnych istnieją mniej konserwatywne metody niż metody Holma (np. Min-P).

2

Patrzyłem na ten sam numer i znalazłem tekst w książce:

Kopia odpowiedniego rozdziału jest dostępna bezpłatnie tutaj:

http://www.utdallas.edu/~herve/Abdi-Bonferroni2007-pretty.pdf

α[P.T.]=1-(1-0,05)(1/10)=0,0051

Szczerze mówiąc, przeglądałem wiele różnych artykułów ekonomicznych / ekonometrycznych dla mojego obecnego projektu badawczego i w tym ograniczonym doświadczeniu nie spotkałem się z wieloma artykułami stosującymi takie poprawki przy porównywaniu 2-5 testów.


Czy możesz podać podsumowanie informacji zawartych w linku tutaj, aby pomóc przyszłym czytelnikom zdecydować, czy chcą je kontynuować i na wypadek, gdyby link zniknął?
Gung - Przywróć Monikę

0

Musisz pamiętać, że dane medyczne i dane naukowe są nie do pogodzenia z tym, że heteroscedastyczne dane medyczne nigdy nie są eksperymentalne w przeciwieństwie do homoscedastycznych danych biologicznych. Przypomnijmy również, że wiele dyskusji na temat roli testów mocy i poprawek typu Bonferroniego obejmuje jedynie spekulacje na temat natury nieznanych alternatywnych rozkładów. Ustawienie beta w obliczeniach mocy jest procedurą arbitralną. Żaden statystyczny lekarz nie reklamuje tego. Po drugie, jeśli występuje autokorelacja (wewnątrz) próbek danych, to zostało naruszone Centralne Twierdzenie Graniczne, a testy Gaussa oparte na Normie nie są prawidłowe. Trzeci, przypomnijmy, że rozkład normalny staje się przestarzały w tym sensie, że wiele zjawisk medycznych jest rozkładami opartymi na fraktale, które nie mają ani skończonych średnich i / lub skończonych wariancji (rozkładów typu Cauchy'ego) i wymagają analiz statystycznych odpornych na fraktale. Przeprowadzanie jakiejkolwiek odpowiedzi post-hoc polegającej na tym, co znajdziesz podczas wczesnej analizy, jest niewłaściwe. Wreszcie, biosektywność między podmiotami niekoniecznie jest ważna, a warunki dla korekt Bonferroniego są ważnymi elementami, które należy jednoznacznie wyjaśnić tylko podczas projektowania eksperymentalnego a priori. Nigel T. James. MB BChir, (stopnie medyczne w Wielkiej Brytanii), mgr (w statystyce stosowanej). biochemiczność między podmiotami niekoniecznie jest ważna, a warunki dla korekt Bonferroniego są ważnymi elementami, które należy jednoznacznie wyjaśnić tylko podczas projektowania eksperymentalnego apriorycznego. Nigel T. James. MB BChir, (stopnie medyczne w Wielkiej Brytanii), mgr (w statystyce stosowanej). biochemiczność między podmiotami niekoniecznie jest ważna, a warunki dla korekt Bonferroniego są ważnymi elementami, które należy jednoznacznie wyjaśnić tylko podczas projektowania eksperymentalnego apriorycznego. Nigel T. James. MB BChir, (stopnie medyczne w Wielkiej Brytanii), mgr (w statystyce stosowanej).

Korzystając z naszej strony potwierdzasz, że przeczytałeś(-aś) i rozumiesz nasze zasady używania plików cookie i zasady ochrony prywatności.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.