Pytania otagowane jako mixed-model

Modele mieszane (inaczej wielopoziomowe lub hierarchiczne) to modele liniowe, które obejmują zarówno efekty stałe, jak i efekty losowe. Służą do modelowania danych podłużnych lub zagnieżdżonych.

2
Co to jest struktura R struktura G w glmm?
MCMCglmmOstatnio korzystam z pakietu. Jestem zdezorientowany tym, co w dokumentacji nazywane jest strukturą R i strukturą G. Wydaje się, że odnoszą się one do efektów losowych - w szczególności określają parametry wcześniejszego rozkładu na nich, ale dyskusja w dokumentacji wydaje się zakładać, że czytelnik wie, jakie są te warunki. Na …
1
Jak analizować dane dotyczące liczby podłużnej: rozliczanie czasowej autokorelacji w GLMM?
Witaj guru statystyczni i kreatorzy programowania R, Interesuje mnie modelowanie chwytów zwierząt jako funkcji warunków środowiskowych i dnia w roku. W ramach innego badania mam liczbę przechwyceń przez ~ 160 dni w ciągu trzech lat. Na każdy z tych dni mam temperaturę, opady, prędkość wiatru, wilgotność względną itp. Ponieważ dane …
3
Dlaczego do wybierania zagnieżdżonych modeli var-covar należy używać REML (zamiast ML)?
Różne opisy wyboru modeli losowych efektów liniowych modeli mieszanych instruują użycie REML. Znam różnicę między REML i ML na pewnym poziomie, ale nie rozumiem, dlaczego REML powinien być używany, ponieważ ML jest stronniczy. Na przykład, czy błędem jest przeprowadzanie LRT na parametrze wariancji normalnego modelu dystrybucji przy użyciu ML (patrz …
2
Intuicja na temat estymacji parametrów w modelach mieszanych (parametry wariancji vs. tryby warunkowe)
Czytałem wiele razy, że efekty losowe (BLUP / tryby warunkowe dla, powiedzmy, badanych) nie są parametrami liniowego modelu efektów mieszanych, ale zamiast tego można je wyprowadzić z oszacowanych parametrów wariancji / kowariancji. Np. Reinhold Kliegl i in. (2011) stan: Efekty losowe to odchylenia badanych od średniej średniej RT i odchylenia …
1
Jak dopasować model mieszany ze zmienną odpowiedzi od 0 do 1?
Próbuję użyć, lme4::glmer()aby dopasować dwumianowy uogólniony model mieszany (GLMM) ze zmienną zależną, która nie jest binarna, ale zmienna ciągła od zera do jednego. Można myśleć o tej zmiennej jako o prawdopodobieństwie; w rzeczywistości jest to prawdopodobieństwo zgłaszane przez ludzi (w eksperymencie, który pomagam analizować). Tj. Nie jest to ułamek „dyskretny”, …
1
Zapisywanie równania matematycznego dla wielopoziomowego modelu efektów mieszanych
Pytanie CV Próbuję podać (a) szczegółową i zwięzłą matematyczną reprezentację modelu efektów mieszanych. Korzystam z lme4pakietu w języku R. Jaka jest prawidłowa reprezentacja matematyczna dla mojego modelu? Dane, pytanie naukowe i kod R. Mój zestaw danych składa się z gatunków w różnych regionach. Testuję, czy występowanie gatunku zmienia się w …
4
Naprawiono efekt vs efekt losowy, gdy wszystkie możliwości są zawarte w modelu efektów mieszanych
W modelu efektów mieszanych zaleca się stosowanie stałego efektu do oszacowania parametru, jeśli uwzględniono wszystkie możliwe poziomy (np. Zarówno mężczyzn, jak i kobiety). Ponadto zaleca się stosowanie efektu losowego w celu uwzględnienia zmiennej, jeśli uwzględnione poziomy są tylko losową próbką z populacji (pacjenci włączeni z wszechświata możliwych pacjentów), a zamiast …
1
Jaka intuicja kryje się za wymiennymi próbkami pod hipotezą zerową?
Testy permutacyjne (zwane również testem randomizacji, testem ponownej randomizacji lub testem dokładnym) są bardzo przydatne i przydają się, gdy t-testnie jest spełnione założenie o rozkładzie normalnym wymagane na przykład i gdy transformacja wartości przez ranking test nieparametryczny, Mann-Whitney-U-testktóry prowadziłby do utraty większej ilości informacji. Jednak nie należy zapominać o jednym …
15 hypothesis-testing  permutation-test  exchangeability  r  statistical-significance  loess  data-visualization  normal-distribution  pdf  ggplot2  kernel-smoothing  probability  self-study  expected-value  normal-distribution  prior  correlation  time-series  regression  heteroscedasticity  estimation  estimators  fisher-information  data-visualization  repeated-measures  binary-data  panel-data  mathematical-statistics  coefficient-of-variation  normal-distribution  order-statistics  regression  machine-learning  one-class  probability  estimators  forecasting  prediction  validation  finance  measurement-error  variance  mean  spatial  monte-carlo  data-visualization  boxplot  sampling  uniform  chi-squared  goodness-of-fit  probability  mixture  theory  gaussian-mixture  regression  statistical-significance  p-value  bootstrap  regression  multicollinearity  correlation  r  poisson-distribution  survival  regression  categorical-data  ordinal-data  ordered-logit  regression  interaction  time-series  machine-learning  forecasting  cross-validation  binomial  multiple-comparisons  simulation  false-discovery-rate  r  clustering  frequency  wilcoxon-mann-whitney  wilcoxon-signed-rank  r  svm  t-test  missing-data  excel  r  numerical-integration  r  random-variable  lme4-nlme  mixed-model  weighted-regression  power-law  errors-in-variables  machine-learning  classification  entropy  information-theory  mutual-information 
1
Wizualizacja wyników modeli mieszanych
Jednym z problemów, które zawsze miałem z modelami mieszanymi, jest wymyślanie wizualizacji danych - takich, które mogłyby skończyć się na papierze lub plakacie - gdy tylko uzyska się wyniki. Obecnie pracuję nad modelem efektów mieszanych Poissona z formułą, która wygląda mniej więcej tak: a <- glmer(counts ~ X + Y …
2
Jak przetestować efekt zmiennej grupującej za pomocą modelu nieliniowego?
Mam pytanie dotyczące zastosowania zmiennej grupującej w modelu nieliniowym. Ponieważ funkcja nls () nie zezwala na zmienne czynnikowe, starałam się dowiedzieć, czy można przetestować wpływ czynnika na dopasowanie modelu. Poniżej zamieściłem przykład, w którym chcę dopasować „sezonowy sezon von Bertalanffy'ego” do różnych metod leczenia wzrostu (najczęściej stosowanych do wzrostu ryb). …
15 r  mixed-model  nls 
1
Dlaczego nie mogę dopasować wyjścia glmer (rodzina = dwumianowy) do ręcznej implementacji algorytmu Gaussa-Newtona?
Chciałbym dopasować wyjścia lmera (naprawdę blasku) do dwumianowego przykładu zabawki. Przeczytałem winiety i wierzę, że rozumiem, co się dzieje. Ale najwyraźniej nie. Po utknięciu, naprawiłem „prawdę” w kategoriach efektów losowych i poszedłem po ocenie samych ustalonych efektów. Podaję ten kod poniżej. Aby zobaczyć, że jest to uzasadnione, możesz skomentować + …
Korzystając z naszej strony potwierdzasz, że przeczytałeś(-aś) i rozumiesz nasze zasady używania plików cookie i zasady ochrony prywatności.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.