Statystyki i duże zbiory danych cox-model

4

Jak interpretować krzywą przeżycia modelu zagrożenia Coxa?

Jak interpretujesz krzywą przeżycia z proporcjonalnego modelu hazardu Coxa? W tym przykładzie zabawki załóżmy, że mamy proporcjonalny model hazardu Coxa dla agezmiennej w kidneydanych i generujemy krzywą przeżycia. library(survival) fit <- coxph(Surv(time, status)~age, data=kidney) plot(conf.int="none", survfit(fit)) grid() Na przykład o czasie 200200200, które stwierdzenie jest prawdziwe? czy oba są w …

9 r survival cox-model likelihood machine-learning deep-learning generative-models machine-learning reinforcement-learning q-learning regression multicollinearity convergence beta-distribution bernoulli-distribution machine-learning self-study pattern-recognition neural-networks stochastic-processes linear

1

Jak wygenerować dane o przeżyciu za pomocą współzmiennych zależnych od czasu za pomocą R.

Chcę wygenerować czas przeżycia na podstawie proporcjonalnego modelu zagrożeń Coxa, który zawiera zmienną zależną od czasu. Model jest h ( t |Xja) =h0( t ) exp( γXja+ αmja( t ) )h(t|Xja)=h0(t)exp⁡(γXja+αmja(t))h(t|X_i) =h_0(t) \exp(\gamma X_i + \alpha m_{i}(t)) gdzie jest generowany z Binomial (1,0.5) i .XjaXjaX_imja( t ) =β0+β1Xja+β2)Xjatmja(t)=β0+β1Xja+β2)Xjatm_{i}(t)=\beta_0 + \beta_1 …

9 r survival cox-model time-varying-covariate

1

Struktura danych i wywołanie funkcji dla danych o zdarzeniach cyklicznych ze zmiennymi zależnymi od czasu

Próbuję oszacować wpływ 2 leków ( drug1, drug2) na prawdopodobieństwo upadku pacjenta ( event). Pacjenci mogą upaść więcej niż jeden raz i mogą być przyjmowani lub zdejmowani z leków w dowolnym momencie. Moje pytanie dotyczy tego, w jaki sposób dane powinny być uporządkowane w odniesieniu do okresu (dni), a konkretnie, …

9 r survival cox-model

2

Interwał ocenzurowany model proporcjonalnych hazardów Coxa w R.

Biorąc pod uwagę czasy przeżycia ocenzurowane w odstępach, w jaki sposób mogę wykonać model ocenzurowanych interwałów Coxa PH R? Rseek search wyświetla pakiet intcox, którego już nie ma w Rrepozytorium. Jestem prawie pewien, że coxphfunkcja w survivalpakiecie nie może obsłużyć ocenzurowanych interwałów przeżycia. Nie chcę też przypisywać danych, a następnie …

9 r survival cox-model interval-censoring

1

Jak porównać obserwowane i oczekiwane zdarzenia?

Załóżmy, że mam jedną próbkę częstotliwości 4 możliwych zdarzeń: Event1 - 5 E2 - 1 E3 - 0 E4 - 12 i mam spodziewane prawdopodobieństwo wystąpienia moich zdarzeń: p1 - 0.2 p2 - 0.1 p3 - 0.1 p4 - 0.6 Dzięki sumie obserwowanych częstotliwości moich czterech zdarzeń (18) mogę obliczyć …

9 r statistical-significance chi-squared multivariate-analysis exponential joint-distribution statistical-significance self-study standard-deviation probability normal-distribution spss interpretation assumptions cox-model reporting cox-model statistical-significance reliability method-comparison classification boosting ensemble adaboost confidence-interval cross-validation prediction prediction-interval regression machine-learning svm regularization regression sampling survey probit matlab feature-selection information-theory mutual-information time-series forecasting simulation classification boosting ensemble adaboost normal-distribution multivariate-analysis covariance gini clustering text-mining distance-functions information-retrieval similarities regression logistic stata group-differences r anova confidence-interval repeated-measures r logistic lme4-nlme inference fiducial kalman-filter classification discriminant-analysis linear-algebra computing statistical-significance time-series panel-data missing-data uncertainty probability multivariate-analysis r classification spss k-means discriminant-analysis poisson-distribution average r random-forest importance probability conditional-probability distributions standard-deviation time-series machine-learning online forecasting r pca dataset data-visualization bayes distributions mathematical-statistics degrees-of-freedom

1

Model proporcjonalnego hazardu Coxa i interpretacja współczynników, gdy występuje interakcja wyższych przypadków

Oto podsumowanie wyników modelu Coxpha, którego użyłem (użyłem R, a wynik jest oparty na najlepszym modelu końcowym, tj. Uwzględniono wszystkie istotne zmienne objaśniające i ich interakcje): coxph(formula = Y ~ LT + Food + Temp2 + LT:Food + LT:Temp2 + Food:Temp2 + LT:Food:Temp2) # Y<-Surv(Time,Status==1) n = 555 coef exp(coef) …

9 r interaction regression-coefficients cox-model

2

Model proporcjonalnego hazardu Coxa i losowo wybrana próbka

Czy istnieją metody korygowania błędu systematycznego w modelu proporcjonalnego hazardu Coxa spowodowanego przez losowo wybraną próbkę (coś w rodzaju korekty Heckmana)? Tło : Załóżmy, że sytuacja wygląda następująco: - W ciągu pierwszych dwóch lat wszyscy klienci są przyjmowani. - Po tych dwóch latach budowany jest model Cox PH. Model przewiduje, …

9 bias cox-model

1

Różny wykres prognostyczny od przeżycia coxph i rms cph

Stworzyłem własną, nieco ulepszoną wersję termplotu, której używam w tym przykładzie. Znajdziesz ją tutaj . Wcześniej pisałem na SO, ale im więcej o tym myślę, uważam, że to prawdopodobnie bardziej dotyczy interpretacji modelu proporcjonalnych zagrożeń Coxa niż faktycznego kodowania. Problem Kiedy patrzę na wykres współczynnika ryzyka, spodziewam się, że będę …

9 r survival cox-model

Pytania otagowane jako cox-model