Pytania otagowane jako r

Użyj tego znacznika w przypadku każdego * pytania na temat *, które (a) obejmuje `R` jako krytyczną część pytania lub oczekiwaną odpowiedź, a (b) nie jest * tylko * o tym, jak używać` R`.

1
Wykresy ilustrujące wyniki liniowego modelu efektu mieszanego
Analizowałem niektóre dane przy użyciu liniowego modelowania efektu mieszanego w R. Planuję zrobić plakat z wynikami i zastanawiałem się, czy ktokolwiek doświadczony z modelami efektu mieszanego może zasugerować, które wykresy zastosować w zilustrowaniu wyników Model. Myślałem o wykresach rezydualnych, wykresie dopasowanych wartości względem wartości oryginalnych itp. Wiem, że będzie to …
2
Jak oszacować wyjściową funkcję hazardu w modelu Coxa z R.
Muszę oszacować wyjściową funkcję hazardu w zależnym od czasu modelu Coxaλ0( t )λ0(t)\lambda_0(t) λ ( t ) = λ0( t ) exp( Z( t )′β)λ(t)=λ0(t)exp⁡(Z(t)′β)\lambda(t) = \lambda_0(t) \exp(Z(t)'\beta) Podczas kursu Survival pamiętam, że bezpośrednia pochodna skumulowanej funkcji hazardu ( ) nie byłaby dobrym estymatorem, ponieważ estymator Breslowa daje funkcję krokową.λ0( …
13 r  survival  cox-model 
1
Warunki interakcji i wielomiany wyższego rzędu
Gdybym był zainteresowany dopasowaniem interakcji dwukierunkowych między liniową zmienną objaśniającą a inną zmienną objaśniającą która ma kwadratowy związek ze zmienną zależną , czy musiałbym uwzględnić zarówno interakcję ze składową kwadratową, jak i interakcję z liniową komponent w modelu? Np .: Z kolei w oparciu o mój poprzedni wątek: Warunki krzywizny …
5
Jak uzyskać region elipsy z dwuwymiarowych normalnych danych rozproszonych?
Mam dane, które wyglądają następująco: Próbowałem zastosować rozkład normalny (szacowanie gęstości jądra działa lepiej, ale nie potrzebuję tak dużej precyzji) i działa całkiem dobrze. Wykres gęstości tworzy elipsę. Potrzebuję uzyskać tę funkcję elipsy, aby zdecydować, czy punkt leży w regionie elipsy, czy nie. Jak to zrobić? Kod R lub Mathematica …
13 r  regression  pdf  bivariate 
2
Obliczanie prawdopodobieństwa nakładania się listy genów między sekwencją RNA a zestawem danych ChIP-chip
Mam nadzieję, że ktoś na tych forach pomoże mi rozwiązać ten podstawowy problem w badaniach nad ekspresją genów. Przeprowadziłem głębokie sekwencjonowanie tkanki eksperymentalnej i kontrolnej. Następnie uzyskałem krotną wartość wzbogacenia genów w próbce eksperymentalnej nad kontrolą. Referencyjny genom ma około 15 000 genów. 3000 z 15 000 genów jest wzbogaconych …
1
Znaczenie osi y na wykresie częściowej zależności losowego lasu
Korzystam z RandomForestpakietu R i nie rozumiem, jak interpretować wartości osi Y na ich wykresach częściowej zależności. Dokumenty pomocnicze stwierdzają, że wykres jest „graficznym przedstawieniem marginalnego wpływu zmiennej na prawdopodobieństwo klasowe”. Nadal jednak nie rozumiem, co dokładnie reprezentuje oś y. W szczególności, co oznaczają wartości ujemne? Co to znaczy mieć …
1
Czy metaanaliza ilorazów szans jest w zasadzie beznadziejna?
W ostatnim artykule Norton i in. (2018) stwierdzają, że[1][1]^{[1]} Różnych ilorazów szans z tego samego badania nie można porównać, gdy modele statystyczne, które dają oszacowania ilorazu szans, mają różne zmienne objaśniające, ponieważ każdy model ma inny arbitralny współczynnik skalowania. Wielkości ilorazu szans z jednego badania nie można także porównać z …
3
Jak zaprogramować symulację Monte Carlo paradoksu pudełkowego Bertranda?
Następujący problem został opublikowany na stronie Mensa International na Facebooku: \quad\quad\quad\quad\quad\quad\quad\quad Sam post otrzymał ponad 1000 komentarzy, ale nie będę wchodził w szczegóły na temat debaty, ponieważ wiem, że jest to paradoks skrzynki Bertranda, a odpowiedź brzmi . Zainteresowało mnie to, w jaki sposób można rozwiązać ten problem, stosując podejście …
1
Uogólnione modele addytywne (GAM), interakcje i zmienne towarzyszące
Eksplorowałem szereg narzędzi do prognozowania i odkryłem, że Uogólnione Modele Addytywne (GAM) mają największy potencjał do tego celu. GRY są świetne! Pozwalają na bardzo zwięzłe określenie złożonych modeli. Jednak ta sama zwięzłość powoduje pewne zamieszanie, szczególnie w odniesieniu do tego, w jaki sposób GAM postrzegają terminy interakcji i zmienne towarzyszące. …
12 r  modeling  gam  mgcv 
2
Wykres QQ wygląda normalnie, ale test Shapiro-Wilka mówi inaczej
W R mam próbkę 348 miar i chcę wiedzieć, czy mogę założyć, że jest ona normalnie dystrybuowana do przyszłych testów. Zasadniczo po kolejnej odpowiedzi stosu patrzę na wykres gęstości i wykres QQ z: plot(density(Clinical$cancer_age)) qqnorm(Clinical$cancer_age);qqline(Clinical$cancer_age, col = 2) Nie mam dużego doświadczenia w statystyce, ale wyglądają jak przykłady normalnych dystrybucji, …
Korzystając z naszej strony potwierdzasz, że przeczytałeś(-aś) i rozumiesz nasze zasady używania plików cookie i zasady ochrony prywatności.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.