Mam dwa zestawy danych z badań asocjacyjnych całego genomu. Jedyne dostępne informacje to iloraz szans i wartość p dla pierwszego zestawu danych. Dla drugiego zestawu danych mam iloraz szans, wartość p i częstotliwości alleli (AFD = choroba, AFC = kontrola) (np. 0,321). Próbuję wykonać metaanalizę tych danych, ale nie mam …
Prowadzę wielopoziomową metaanalizę, która obejmuje niektóre artykuły z wieloma wynikami. Dlatego używam tej rma.mv()funkcji. Przykładowy kod: test.main = rma.mv(yi,vi,random = ~1|ID, data = data) Mam dwa pytania: Czytałem w poprzedniej kwerendy , które podczas używania rma.mv(), ranktest()nie jest wiarygodnym testem funnel plot asymetrii. Jeśli jednak wariancja próbki zostałaby dodana do …
Pracuję nad metaanalizą efektów losowych obejmującą szereg badań, w których nie zgłoszono odchyleń standardowych; we wszystkich badaniach podano wielkość próby. Nie sądzę, że możliwe jest przybliżenie lub przypisanie brakujących danych SD. W jaki sposób metaanaliza wykorzystująca surowe (niestandaryzowane) powinna oznaczać różnice jako wielkość efektu, gdy odchylenia standardowe nie są dostępne …
Przeprowadzam metaanalizę wielkości efektu dw R za pomocą pakietu metafor. d reprezentuje różnice w wynikach pamięci między pacjentami a zdrowymi. Jednak niektóre badania donoszą jedynie o wynikach zainteresowania d (np. Kilka różnych wyników pamięci lub wyników z trzech oddzielnych bloków testowania pamięci). Zapoznaj się z poniższym zestawem danych pozornych, gdzie …
Załóżmy, że chcemy wnioskować na podstawie nieobserwowanej realizacji losowej zmiennej , która normalnie jest dystrybuowana ze średnią i wariancją . Załóżmy, że istnieje inna zmienna losowa (której nieobserwowaną realizację podobnie nazywamy ), która jest normalnie dystrybuowana ze średnią i wariancją . Niech będzie kowariancją i .xxxx~x~\tilde xμxμx\mu_xσ2xσx2\sigma^2_xy~y~\tilde yyyyμyμy\mu_yσ2yσy2\sigma^2_yσxyσxy\sigma_{xy}x~x~\tilde xy~y~\tilde y …
Powiedzmy, że przeprowadzam analizę, patrząc na konkretną miarę zdrowia. Interesuje mnie różnica w tym pomiarze między pacjentami a grupą kontrolną oraz to, czy różnica ta różni się od 0. W przeszłości były badania dotyczące tego samego pytania badawczego i miary zdrowia, ale w różnych próbkach pacjentów. W mojej analizie bayesowskiej …
Z tego artykułu pochodzą następujące przeszczepy . Jestem nowicjuszem w bootstrapie i próbuję zaimplementować parametryczne, semiparametryczne i nieparametryczne bootstrapowanie dla liniowego modelu mieszanego z R bootpakietem. Kod R. Oto mój Rkod: library(SASmixed) library(lme4) library(boot) fm1Cult <- lmer(drywt ~ Inoc + Cult + (1|Block) + (1|Cult), data=Cultivation) fixef(fm1Cult) boot.fn <- function(data, …
Mam dwa zestawy danych z badań asocjacyjnych całego genomu. Jedynymi dostępnymi informacjami są współczynniki nieparzyste i przedziały ufności (95%) dla każdego genotypowanego SNP. Chcę wygenerować działkę leśną porównującą te dwa współczynniki szans, ale nie mogę znaleźć sposobu na obliczenie łączonych przedziałów ufności w celu wizualizacji efektów podsumowania. Użyłem programu PLINK …
Znam metaanalizę i techniki regresji meta (przy użyciu pakietu R metaforfirmy Viechtbauer), ale ostatnio natknąłem się na problem, którego nie mogę łatwo rozwiązać. Powiedzmy, że mamy chorobę, która może przejść od matki do nienarodzonego dziecka, i była badana już wiele razy. Matka i dziecko zostały przetestowane na obecność wirusa zaraz …
Używamy plików cookie i innych technologii śledzenia w celu poprawy komfortu przeglądania naszej witryny, aby wyświetlać spersonalizowane treści i ukierunkowane reklamy, analizować ruch w naszej witrynie, i zrozumieć, skąd pochodzą nasi goście.
Kontynuując, wyrażasz zgodę na korzystanie z plików cookie i innych technologii śledzenia oraz potwierdzasz, że masz co najmniej 16 lat lub zgodę rodzica lub opiekuna.