Pytania otagowane jako jags

„JAGS to Just Another Gibbs Sampler. Jest to program do analizy hierarchicznych modeli bayesowskich przy użyciu symulacji Markov Chain Monte Carlo (MCMC), podobnie jak BUGS”. (http://mcmc-jags.sourceforge.net/)

4
OpenBugs vs. JAGS
Za chwilę wypróbuję środowisko w stylu BUGS do szacowania modeli bayesowskich. Czy są jakieś ważne zalety, które należy wziąć pod uwagę, wybierając pomiędzy OpenBugs lub JAGS? Czy jedna może zastąpić drugą w dającej się przewidzieć przyszłości? Będę używać wybranego Gibbsa Samplera z R. Nie mam jeszcze konkretnej aplikacji, ale raczej …
41 r  software  bugs  jags  gibbs 
2
Jakie wcześniejsze rozkłady mogłyby / powinny być zastosowane dla wariancji w hierarchicznym modelu bayezjańskim, gdy interesująca jest średnia wariancja?
W szeroko cytowanym artykule Wcześniejsze rozkłady parametrów wariancji w modelach hierarchicznych (916 cytowanie do tej pory na Google Scholar) Gelman sugeruje, że dobre wcześniejsze nieinformacyjne wcześniejsze rozkłady dla wariancji w hierarchicznym modelu bayesowskim to rozkład równomierny i rozkład połowy t. Jeśli dobrze rozumiem, działa to dobrze, gdy parametr lokalizacji (np. …
2
Parametry bez zdefiniowanych priorytetów w Stan
Właśnie zacząłem uczyć się używać Stana i rstan. Chyba że zawsze byłem zdezorientowany, jak działały JAGS / BŁĘDY, myślałem, że zawsze musisz zdefiniować jakiś wcześniejszy rozkład dla każdego parametru w modelu, z którego chcesz czerpać. Wygląda na to, że nie musisz tego robić w Stanie na podstawie jego dokumentacji. Oto …
1
Uregulowana bayesowska regresja logistyczna w JAGS
Istnieje kilka prac matematycznych opisujących lasso bayesowskie, ale chcę przetestować poprawny kod JAGS, którego mogę użyć. Czy ktoś może opublikować próbkę kodu BŁĘDY / JAGS, który implementuje regulowaną regresję logistyczną? Każdy schemat (L1, L2, Elasticnet) byłby świetny, ale preferowany jest Lasso. Zastanawiam się także, czy istnieją ciekawe alternatywne strategie wdrażania.
2
MCMC zbiega się w jedną wartość?
Próbuję dopasować model hierarchiczny za pomocą jags i pakietu rjags. Moja zmienna wyniku to y, która jest sekwencją prób bernoulli. Mam 38 ludzi, którzy występują w dwóch kategoriach: P i M. Na podstawie mojej analizy każdy mówca ma prawdopodobieństwo sukcesu w kategorii P i prawdopodobieństwo sukcesu w kategorii M . …
1
Jak generować prognozy za pomocą rjagów?
Użyłem rjags do uruchomienia MCMC na modelu określonym w języku JAGS. Czy istnieje dobry sposób na wyodrębnienie tego modelu i wykonanie z nim prognoz (przy użyciu tylnych rozkładów moich parametrów)? Mogę ponownie określić model w R i podłączyć tryby moich parametrów tylnych; Zastanawiam się tylko, czy istnieje mniej zbędny sposób …
12 r  jags 
1
Zarządzanie wysoką autokorelacją w MCMC
Buduję raczej złożony hierarchiczny model bayesowski do metaanalizy przy użyciu R i JAGS. Upraszczając nieco, dwa kluczowe poziomy modelu mają gdzie jest obserwacją punkt końcowy (w tym przypadku plony GMO i GMO) w badaniu , jest efektem dla badania , są efektami dla różnych zmiennych na poziomie badania (status rozwoju …
2
Hierarchiczne modele dla wielu porównań - kontekst wielu wyników
Właśnie (ponownie) czytałem Gelmana Dlaczego (zwykle) nie musimy się martwić wielokrotnymi porównaniami . W szczególności sekcja „Wiele wyników i inne wyzwania” wspomina o zastosowaniu modelu hierarchicznego w sytuacjach, gdy istnieje wiele powiązanych środków od tej samej osoby / jednostki w różnych czasach / warunkach. Wydaje się, że ma wiele pożądanych …
2
Cenzura / Obcięcie w JAGS
Mam pytanie, jak dopasować problem cenzury do JAGS. Obserwuję normalną dwuwymiarową mieszaninę, w której wartości X mają błąd pomiaru. Chciałbym zamodelować prawdziwe podstawowe „średnie” zaobserwowanych wartości cenzurowanych. ⌈ xt r u e+ ϵ ⌉ = xo b s e r v e d ε ~ N( 0 , s d= …
Korzystając z naszej strony potwierdzasz, że przeczytałeś(-aś) i rozumiesz nasze zasady używania plików cookie i zasady ochrony prywatności.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.