Pytania otagowane jako r

Użyj tego znacznika w przypadku każdego * pytania na temat *, które (a) obejmuje `R` jako krytyczną część pytania lub oczekiwaną odpowiedź, a (b) nie jest * tylko * o tym, jak używać` R`.

1
Redukcja wymiarów (SVD lub PCA) na dużej, rzadkiej matrycy
/ edit: Dalsze działania teraz możesz użyć irlba :: prcomp_irlba / edit: śledzenie mojego własnego posta. irlbama teraz argumenty „środkowy” i „skalowany”, które pozwalają go używać do obliczania podstawowych składników, np .: pc <- M %*% irlba(M, nv=5, nu=0, center=colMeans(M), right_only=TRUE)$v Mam dużą różnorodność Matrixfunkcji, których chciałbym użyć w algorytmie …
2
Jak wykreślić granicę decyzyjną klasyfikatora k-najbliższego sąsiada na podstawie elementów uczenia statystycznego?
Chcę wygenerować fabułę opisaną w książce ElemStatLearn „Elementy statystycznego uczenia się: eksploracja danych, wnioskowanie i przewidywanie. Drugie wydanie” Trevora Hastiego i Roberta Tibshirani i Jerome Friedmana. Fabuła jest: Zastanawiam się, jak mogę stworzyć ten dokładny wykres R, szczególnie zwróć uwagę na grafikę i obliczenia siatki, aby pokazać granicę.
1
Wiele porównań w modelu efektów mieszanych
Próbuję analizować niektóre dane przy użyciu modelu efektu mieszanego. Zebrane przeze mnie dane przedstawiają masę niektórych młodych zwierząt o różnym genotypie w czasie. Korzystam z zaproponowanego tutaj podejścia: https://gribblelab.wordpress.com/2009/03/09/repeated-measures-anova-using-r/ W szczególności używam rozwiązania nr 2 Więc mam coś takiego require(nlme) model <- lme(weight ~ time * Genotype, random = ~1|Animal/time, …
3
Wizualizacja miliona edycji PCA
Czy możliwe jest zwizualizowanie wyników analizy głównych składników w sposób zapewniający lepszy wgląd niż tylko tabele podsumowań? Czy można to zrobić, gdy liczba obserwacji jest duża, powiedzmy ~ 1e4? I czy można to zrobić w R [mile widziane inne środowiska]?
6
Jak zwiększyć długoterminową odtwarzalność badań (szczególnie przy użyciu R i Sweave)
Kontekst: W odpowiedzi na wcześniejsze pytanie dotyczące powtarzalnych badań Jake napisał Jednym z problemów, który odkryliśmy podczas tworzenia naszego archiwum JASA, była zmiana wersji i domyślnych pakietów CRAN. Tak więc w tym archiwum uwzględniamy również wersje używanych pakietów. System oparty na winietach prawdopodobnie się zepsuje, gdy ludzie zmienią swoje paczki …
2
Względne znaczenie zestawu predyktorów w losowej klasyfikacji lasów w R.
Chciałbym określić względną ważność zbiorów zmiennych w stosunku do randomForestmodelu klasyfikacji w R. importanceFunkcja zapewnia MeanDecreaseGinimetrykę dla każdego predyktora - czy jest to tak proste, jak sumowanie tego dla każdego predyktora w zestawie? Na przykład: # Assumes df has variables a1, a2, b1, b2, and outcome rf <- randomForest(outcome ~ …
3
Czy można obliczyć AIC i BIC dla modeli regresji lasso?
Czy można obliczyć wartości AIC lub BIC dla modeli regresji lasso i innych modeli znormalizowanych, w których parametry tylko częściowo wchodzą do równania. Jak określa się stopnie swobody? Używam R, aby dopasować modele regresji lasso z glmnet()funkcją z glmnetpakietu i chciałbym wiedzieć, jak obliczyć wartości AIC i BIC dla modelu. …
31 r  model-selection  lasso  aic  bic 
2
Co to jest rozkład quasi-dwumianowy (w kontekście GLM)?
Mam nadzieję, że ktoś zapewni intuicyjny przegląd tego, czym jest dystrybucja quasibinomial i co robi. Szczególnie interesują mnie następujące punkty: Jak quasibinomial różni się od rozkładu dwumianowego. Gdy zmienna odpowiedzi jest proporcją (przykładowe wartości obejmują 0,23, 0,11, 0,78, 0,98), model quasibinomial będzie działał w R, ale model dwumianowy nie. Dlaczego …
1
Co robi komenda anova () z obiektem modelu Lmer?
Mam nadzieję, że jest to pytanie, na które ktoś tutaj może mi odpowiedzieć na temat natury rozkładania sum kwadratów z dopasowanego modelu mieszanego lmer(z pakietu lme4 R). Po pierwsze powinienem powiedzieć, że jestem świadomy kontrowersji związanych z zastosowaniem tego podejścia, aw praktyce bardziej prawdopodobne byłoby użycie LRT z bootstrapem do …
2
Porównanie lmer i lmer
Zastanawiałem się, czy ktokolwiek mógłby mnie oświecić na temat obecnych różnic między tymi dwiema funkcjami. Znalazłem następujące pytanie: Jak wybrać bibliotekę nlme lub lme4 R dla modeli efektów mieszanych? , ale pochodzi to sprzed kilku lat. To całe życie w kręgach oprogramowania. Moje konkretne pytania to: Czy są (nadal) jakieś …
2
Test rozkładu bimodalnego
Zastanawiam się, czy istnieje jakiś test statystyczny do „przetestowania” znaczenia rozkładu bimodalnego. Mam na myśli, w jakim stopniu moje dane spełniają rozkład bimodalny, czy nie? Jeśli tak, czy jest jakiś test w programie R?
4
Jak przeprowadzić redukcję wymiarowości za pomocą PCA w R.
Mam duży zestaw danych i chcę przeprowadzić redukcję wymiarów. Teraz wszędzie czytam, że mogę do tego użyć PCA. Jednak nadal nie wydaje mi się, co robić po obliczeniu / wykonaniu PCA. W R można to łatwo zrobić za pomocą polecenia princomp. Ale co zrobić po obliczeniu PCA? Jeśli zdecydowałem, że …
30 r  pca 
Korzystając z naszej strony potwierdzasz, że przeczytałeś(-aś) i rozumiesz nasze zasady używania plików cookie i zasady ochrony prywatności.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.