Pytania otagowane jako lme4-nlme

lme4 i nlme są pakietami R stosowanymi do dopasowania liniowych, uogólnionych liniowych i nieliniowych modeli efektów mieszanych. W przypadku ogólnych pytań dotyczących modeli mieszanych użyj znacznika [mieszany model].

1
Jak interpretować współczynniki wielowymiarowego modelu mieszanego w lme4 bez ogólnego przechwytywania?
Usiłuję dopasować model mieszany wielowymiarowy (tj. Wiele odpowiedzi) R. Oprócz pakietów ASReml-ri SabreR(które wymagają zewnętrznego oprogramowania) wydaje się, że jest to możliwe tylko w MCMCglmm. w artykule dołączonym do MCMCglmmpakietu (str. 6) Jarrod Hadfield opisuje proces dopasowywania takiego modelu, jak na przykład przekształcanie wielu zmiennych odpowiedzi w jedną zmienną o …
2
Hierarchiczne modele dla wielu porównań - kontekst wielu wyników
Właśnie (ponownie) czytałem Gelmana Dlaczego (zwykle) nie musimy się martwić wielokrotnymi porównaniami . W szczególności sekcja „Wiele wyników i inne wyzwania” wspomina o zastosowaniu modelu hierarchicznego w sytuacjach, gdy istnieje wiele powiązanych środków od tej samej osoby / jednostki w różnych czasach / warunkach. Wydaje się, że ma wiele pożądanych …
2
Porównanie modelu mieszanego (podmiot jako efekt losowy) z prostym modelem liniowym (przedmiot jako efekt stały)
Kończę analizę dużej grupy danych. Chciałbym wziąć model liniowy zastosowany w pierwszej części pracy i ponownie go dopasować za pomocą liniowego modelu mieszanego (LME). LME byłby bardzo podobny, z tym wyjątkiem, że jedna ze zmiennych zastosowanych w modelu byłaby zastosowana jako efekt losowy. Te dane pochodzą z wielu obserwacji (> …
1
Dlaczego miałbyś przewidywać na podstawie modelu efektu mieszanego bez uwzględnienia efektów losowych dla prognozy?
Jest to bardziej pytanie koncepcyjne, ale w miarę używania Rbędę odwoływał się do pakietów w R. Jeśli celem jest dopasowanie modelu liniowego do celów przewidywania, a następnie dokonanie prognoz, w których efekty losowe mogą być niedostępne, czy jest jakaś korzyść ze stosowania modelu efektów mieszanych, czy zamiast tego należy zastosować …
2
REML vs ML stepAIC
Czuję się przytłoczony po próbie zagłębienia się w literaturze na temat tego, jak uruchomić moją analizę modeli mieszanych, a następnie użyć AIC do wyboru najlepszego modelu lub modeli. Nie sądzę, że moje dane są tak skomplikowane, ale szukam potwierdzenia, że ​​to, co zrobiłem, jest prawidłowe, a następnie doradzam, jak postępować. …
3
Bakterie zbierane na palcach po wielu kontaktach powierzchniowych: dane nienormalne, powtarzane pomiary, skrzyżowane osoby
Wprowadzenie Mam uczestników, którzy wielokrotnie dotykają skażonych powierzchni E. coli w dwóch warunkach ( A = w rękawiczkach, B = bez rękawiczek). Chcę wiedzieć, czy istnieje różnica między ilością bakterii na opuszkach palców w rękawicach i bez rękawiczek, ale także między liczbą kontaktów. Oba czynniki są wewnątrz uczestników. Metoda eksperymentalna: …
3
Co zrobić z korelacją efektów losowych równą 1 lub -1?
Nierzadko zdarza się, gdy mamy do czynienia ze złożonymi maksymalnymi modelami mieszanymi (szacowanie wszystkich możliwych efektów losowych dla danych i modelu) jest idealna (+1 lub -1) lub prawie idealna korelacja między niektórymi efektami losowymi. Na potrzeby dyskusji przyjrzyjmy się poniższemu modelowi i podsumowaniu modelu Model: Y ~ X*Cond + (X*Cond|subj) …
1
Pomóż w interpretacji danych zliczania GLMM za pomocą lme4 glmer and glmer.nb - Dwumian ujemny kontra Poisson
Mam pytania dotyczące specyfikacji i interpretacji GLMM. 3 pytania są zdecydowanie statystyczne, a 2 dotyczą bardziej R. Piszę tutaj, ponieważ ostatecznie myślę, że problemem jest interpretacja wyników GLMM. Obecnie próbuję dopasować GLMM. Korzystam z danych amerykańskiego spisu ludności z bazy danych podłużnych dróg . Moje obserwacje są traktatami spisowymi. Moją …
1
Model efektów mieszanych z splajnami
Dopasowuję model efektów mieszanych z terminem spline w aplikacji, w której trend w czasie jest znany jako curvi-liniowy. Chciałbym jednak ocenić, czy trend krzywoliniowy występuje z powodu indywidualnego odchylenia od liniowości, czy jest to efekt na poziomie grupy, który sprawia, że ​​dopasowanie na poziomie grupy wydaje się krzywoliniowo-liniowe. Podaję powtarzalny …
9 r  splines  lme4-nlme 
1
Jak ustawić niestandardowe kontrasty z lmer w R.
Używam lmera w R, aby sprawdzić wpływ warunku ( cond) na jakiś wynik. Oto niektóre skompilowane dane, gdzie s jest identyfikatorem podmiotu i a, bi csą warunkami. library("tidyr") library("dplyr") set.seed(123) temp <- data.frame(s = paste0("S", 1:30), a = rnorm(30, -2, 1), b = rnorm(30, -3, 1), c = rnorm(30, -4, …
Korzystając z naszej strony potwierdzasz, że przeczytałeś(-aś) i rozumiesz nasze zasady używania plików cookie i zasady ochrony prywatności.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.