Pytania otagowane jako lme4-nlme

lme4 i nlme są pakietami R stosowanymi do dopasowania liniowych, uogólnionych liniowych i nieliniowych modeli efektów mieszanych. W przypadku ogólnych pytań dotyczących modeli mieszanych użyj znacznika [mieszany model].

4
Jak dopasować model wielopoziomowy do nadmiernie rozproszonych efektów Poissona?
Chcę dopasować wielopoziomowy GLMM z rozkładem Poissona (z nadmierną dyspersją) za pomocą R. W tej chwili używam lme4, ale zauważyłem, że ostatnio quasipoissonrodzina została usunięta. Widziałem gdzie indziej, że można modelować nadmierną dyspersję addytywną dla rozkładów dwumianowych, dodając losowy punkt przecięcia z jednym poziomem na obserwację. Czy dotyczy to również …
1
Co robi komenda anova () z obiektem modelu Lmer?
Mam nadzieję, że jest to pytanie, na które ktoś tutaj może mi odpowiedzieć na temat natury rozkładania sum kwadratów z dopasowanego modelu mieszanego lmer(z pakietu lme4 R). Po pierwsze powinienem powiedzieć, że jestem świadomy kontrowersji związanych z zastosowaniem tego podejścia, aw praktyce bardziej prawdopodobne byłoby użycie LRT z bootstrapem do …
2
Porównanie lmer i lmer
Zastanawiałem się, czy ktokolwiek mógłby mnie oświecić na temat obecnych różnic między tymi dwiema funkcjami. Znalazłem następujące pytanie: Jak wybrać bibliotekę nlme lub lme4 R dla modeli efektów mieszanych? , ale pochodzi to sprzed kilku lat. To całe życie w kręgach oprogramowania. Moje konkretne pytania to: Czy są (nadal) jakieś …
2
W modelu wielopoziomowym, jakie są praktyczne implikacje oszacowania w porównaniu z niedoszacowaniem parametrów korelacji efektu losowego?
W modelu wielopoziomowym, jakie są praktyczne i związane z interpretacją implikacje oszacowania w porównaniu z niedoszacowaniem parametrów korelacji efektu losowego? Praktycznym powodem pytania jest to, że w ramce Lmer w R nie ma zaimplementowanej metody szacowania wartości p za pomocą technik MCMC, gdy dokonuje się szacunków w modelu korelacji między …
5
Przykładowe raporty analizy mieszanych modeli z wykorzystaniem lmerów w biologii, psychologii i medycynie?
Ponieważ ogólną zgodą wydaje się być stosowanie modeli mieszanych lmer()w R zamiast klasycznej ANOVA (z często cytowanych powodów, takich jak niezrównoważone projekty, skrzyżowane efekty losowe itp.), Chciałbym spróbować z moimi danymi. Martwię się jednak, że będę w stanie „sprzedać” to podejście mojemu przełożonemu (który w końcu oczekuje klasycznej analizy z …
3
Czy AIC może porównywać różne typy modeli?
Używam AIC (Akaike's Information Criterion) do porównywania modeli nieliniowych w R. Czy warto porównywać AIC różnych typów modeli? Konkretnie porównuję model dopasowany przez glm do modelu z terminem efektu losowego dopasowanego przez glmer (lme4). Jeśli nie, to czy można dokonać takiego porównania? A może pomysł jest całkowicie nieważny?
1
przewidywanie () Funkcja dla mniejszych modeli efektów mieszanych
Problem: Przeczytałem w innych postach, które predictnie są dostępne dla lmermodeli z efektami mieszanymi {lme4} w [R]. Próbowałem zgłębić ten temat za pomocą zestawu danych o zabawkach ... Tło: Zestaw danych jest dostosowany z tego źródła i dostępny jako ... require(gsheet) data <- read.csv(text = gsheet2text('https://docs.google.com/spreadsheets/d/1QgtDcGJebyfW7TJsB8n6rAmsyAnlz1xkT3RuPFICTdk/edit?usp=sharing', format ='csv')) Oto pierwsze …
3
Jak interpretować „korelacje ustalonych efektów” w mojej produkcji glittera?
Mam następujące dane wyjściowe: Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation Formula: aph.remain ~ sMFS2 +sAG2 +sSHDI2 +sbare +season +crop +(1|landscape) AIC BIC logLik deviance 4062 4093 -2022 4044 Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. landscape (Intercept) 0.82453 0.90804 Number of obs: 239, groups: landscape, 45 Fixed effects: …
2
Czy poprawnie podałem swój model w lmer?
Przeszukałem wiele stron pomocy i wciąż nie jestem pewien, jak określić bardziej skomplikowane terminy zagnieżdżone w modelu mieszanym. Jestem również mylić jak wykorzystanie :i /oraz |w określaniu i gniazdowania interakcje z czynnikami losowymi wykorzystujących lmer()w lme4opakowaniu w R. Na potrzeby tego pytania załóżmy, że dokładnie przedstawiłem moje dane za pomocą …
1
Kiedy teoretycznie brzmią modele mieszane z zerową korelacją?
Cytat blokowy poniżej, od liderów w dziedzinie modelowania efektów mieszanych, twierdzi, że koordynacja przesunięć w modelach z zerową korelacją między efektami losowymi (modele „ZCP”) zmienia prognozy modeli. Ale czy ktoś może rozwinąć lub uzasadnić swoje roszczenia? Sprawozdania te zostały wydane z Bates wsp za 2015 na papierze lme4, Montaż liniowe …
5
Jak przetestować i uniknąć wielokoliniowości w mieszanym modelu liniowym?
Obecnie korzystam z modeli liniowych z mieszanym efektem. Korzystam z pakietu „lme4” w języku R. Moje modele mają postać: model <- lmer(response ~ predictor1 + predictor2 + (1 | random effect)) Przed uruchomieniem moich modeli sprawdziłem możliwą wielokoliniowość między predyktorami. Zrobiłem to przez: Utwórz ramkę danych predyktorów dummy_df <- data.frame(predictor1, …
4
Sprawdzanie założeń mieszanych modeli lmer / lme w R.
Przeprowadziłem powtarzający się projekt, w którym przetestowałem 30 mężczyzn i 30 kobiet w trzech różnych zadaniach. Chcę zrozumieć, jak różni się zachowanie mężczyzn i kobiet i jak to zależy od zadania. Użyłem zarówno pakietu lmer, jak i lme4, aby to zbadać, jednak utknąłem przy próbie sprawdzenia założeń dla każdej z …
Korzystając z naszej strony potwierdzasz, że przeczytałeś(-aś) i rozumiesz nasze zasady używania plików cookie i zasady ochrony prywatności.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.