Pytania otagowane jako lme4-nlme

lme4 i nlme są pakietami R stosowanymi do dopasowania liniowych, uogólnionych liniowych i nieliniowych modeli efektów mieszanych. W przypadku ogólnych pytań dotyczących modeli mieszanych użyj znacznika [mieszany model].

2
Dlaczego otrzymuję zerową wariancję efektu losowego w moim modelu mieszanym, pomimo pewnych różnic w danych?
Przeprowadziliśmy regresję logistyczną efektów mieszanych przy użyciu następującej składni; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Przedmiot i przedmiot to efekty losowe. Otrzymujemy nieparzysty wynik, który jest współczynnikiem, a odchylenie standardowe dla przedmiotowego terminu wynosi …
1
Korelacja międzyklasowa (ICC) dla interakcji?
Załóżmy, że mam pewien pomiar dla każdego przedmiotu w każdej witrynie. Dwie zmienne, przedmiot i miejsce, są interesujące pod względem obliczania wartości korelacji wewnątrzklasowej (ICC). Zazwyczaj używałbym funkcji lmerz pakietu R lme4i uruchamiał się lmer(measurement ~ 1 + (1 | subject) + (1 | site), mydata) Wartości ICC można uzyskać …
2
Jak zastosować dwumianowy GLMM (glmer) do wartości procentowych zamiast tak-nie ma znaczenia?
Mam eksperyment z powtarzanymi pomiarami, w którym zmienna zależna jest procentem, i mam wiele czynników jako zmienne niezależne. Chciałbym użyć glmerpakietu R, lme4aby potraktować go jako problem z regresją logistyczną (poprzez określenie family=binomial), ponieważ wydaje się, że bezpośrednio dostosowuje się on do tej konfiguracji. Moje dane wyglądają tak: > head(data.xvsy) …
2
Ostrzeżenie „Model nie zbiegło się” w lmer ()
Za pomocą następującego zestawu danych chciałem sprawdzić, czy odpowiedź (efekt) zmienia się w odniesieniu do witryn, sezonu, czasu trwania i ich interakcji. Niektóre internetowe fora poświęcone statystykom sugerowały, żebym kontynuował liniowe modele z efektami mieszanymi, ale problem polega na tym, że ponieważ replikacje są losowe w każdej stacji, nie mam …
1
lme () i lmer () dają sprzeczne wyniki
Pracowałem z niektórymi danymi, które mają pewne problemy z powtarzanymi pomiarami. W ten sposób zauważyłem bardzo różne zachowanie między danymi testowymi lme()i ich lmer()używanie i chcę wiedzieć, dlaczego. Fałszywy zestaw danych, który utworzyłem, zawiera pomiary wzrostu i masy ciała dla 10 osób, wykonane dwukrotnie. Ustawiłem dane tak, aby między badanymi …
2
Dozwolone porównania modeli efektów mieszanych (przede wszystkim efektów losowych)
Patrzyłem na modelowanie efektów mieszanych przy użyciu pakietu lme4 w R. Używam głównie lmerpolecenia, więc zadam pytanie poprzez kod, który używa tej składni. Przypuszczam, że ogólne łatwe pytanie może być takie: czy można porównywać dowolne dwa modele zbudowane przy lmerużyciu współczynników wiarygodności opartych na identycznych zestawach danych? Uważam, że odpowiedzią …
2
Sparowany test t jako specjalny przypadek liniowego modelowania z mieszanym efektem
Wiemy, że sparowany test t jest tylko specjalnym przypadkiem jednokierunkowej ANOVA z powtarzanymi pomiarami (lub wewnątrz podmiotu), a także liniowym modelem mieszanego efektu, który można zademonstrować za pomocą funkcji lme () pakiet nlme w języku R jak pokazano niżej. #response data from 10 subjects under two conditions x1<-rnorm(10) x2<-1+rnorm(10) # …
1
Czy lmer () może używać splajnów jako efektów losowych?
Załóżmy, że pracujemy nad modelem efektów losowych niektórych danych zliczanych w czasie i chcemy kontrolować niektóre trendy. Zwykle zrobiłbyś coś takiego: lmer(counts ~ dependent_variable + (1+t+I(t^2)|ID), family="poisson") zawierać kwadratowy kształt dla t. Czy można zastosować bardziej wyrafinowane techniki wygładzania, takie jak wygładzanie LOESS lub splajny, aby modelować ten związek?
3
Interpretacja trzech form „modelu mieszanego”
Jest takie rozróżnienie, które wprawia mnie w zakłopotanie w przypadku modeli mieszanych i zastanawiam się, czy mógłbym uzyskać trochę jasności. Załóżmy, że masz mieszany model danych zliczania. Istnieje zmienna, o której wiesz, że chcesz jako efekt stały (A), oraz inna zmienna czasu (T), pogrupowana według powiedzonej zmiennej „Site”. Tak jak …
Korzystając z naszej strony potwierdzasz, że przeczytałeś(-aś) i rozumiesz nasze zasady używania plików cookie i zasady ochrony prywatności.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.