Hipoteza zerowa nie jest równoważna z uprzednim pozbawionym informacji Bayesowskim z tego prostego powodu, że Bayesianie mogą również stosować hipotezę zerową i przeprowadzać testy hipotez z wykorzystaniem czynników Bayesa. Gdyby były równoważne, Bayesianie nie użyliby hipotez zerowych.
Jednak zarówno testy częstościowe, jak i bayesowskie uwzględniają element samosceptycyzmu, ponieważ musimy wykazać, że istnieją dowody, że nasza alternatywna hipoteza jest w pewien sposób bardziej prawdopodobnym wyjaśnieniem obserwacji niż przypadkowa przypadek. Częstokroć robią to, mając poziom istotności, Bayesianie robią to, stosując skalę interpretacji dla współczynnika Bayesa, tak że nie stanowczo ogłaszalibyśmy hipotezy, chyba że współczynnik Bayesa ponad hipotezę zerową byłby wystarczająco wysoki.
Powodem, dla którego testy hipotetyczne często są sprzeczne z intuicją, jest to, że częsty nie może przypisać nietrywialnego prawdopodobieństwa prawdzie hipotezy, której niestety generalnie chcemy. Najbliżej tego są w stanie obliczyć wartość p (prawdopodobieństwo obserwacji pod H0), a następnie wyciągnąć z tego subiektywny wniosek, czy H0 lub H1 są wiarygodne. Bayesian może przypisać prawdopodobieństwo do prawdziwości hipotezy, a zatem może obliczyć stosunek tych prawdopodobieństw, aby zapewnić wskazanie ich względnych prawdopodobieństw lub przynajmniej tego, w jaki sposób obserwacje zmieniają stosunek tych prawdopodobieństw (co jest Czynnik Bayesa).
Moim zdaniem, złym pomysłem jest próba zbyt ścisłego zbliżenia metod testowania hipotez Bayesowskich, ponieważ są one zasadniczo różne i odpowiadają na zasadniczo różne pytania. Traktowanie ich tak, jakby były równoważne, zachęca do bayesowskiej interpretacji testu częstościowego (np. Błąd wartości p), który jest potencjalnie niebezpieczny (na przykład sceptycy klimatyczni często zakładają, że brak statystycznie istotnego trendu w średniej globalnej temperaturze powierzchni oznacza, że istnieje nie było ocieplenia - co wcale nie jest poprawne).