Ekstrakcja plików .gz zawartych w folderze

Mam folder zawierający około 320116 plików .pdb.gz. Chcę je wszystkie zdekompresować. Jeśli użyję gunzip * .gz, pojawia się błąd, tzn. Lista argumentów jest za długa. Folder ma około 2 GB. Proszę o odpowiednią sugestię.

find . -name '*.pdb.gz' -exec gunzip {} +

-exec gunzip {} +zapewni gunzipwiele, ale nie za dużo nazw plików w wierszu poleceń. Jest to bardziej wydajne niż w przypadku, -exec gunzip {} \;gdy rozpoczyna się nowy gunzipproces dla każdego pliku.

Ilekroć pojawią się błędy „zbyt długiej listy argumentów”, możesz obejść ją, wielokrotnie wywołując żądane polecenie, za każdym razem z podzbiorem argumentów, których chcesz użyć. xargsto narzędzie, które pomaga to zrobić automatycznie.

find . -type f -a -name \*.pdb.gz -print0 | xargs -0 gunzip

Myślę, że to powinno działać, przekazuje ścieżkę / nazwę każdego pliku osobno do gunzip w celu przetworzenia:

find /my/dir -name "*.pdb.gz" -execdir gunzip "{}" \;

Wypróbuj w ten sposób:

find . -name '*.gz' -exec gunzip {} \;

Jeśli masz maszynę wielordzeniową, prawdopodobnie zauważysz, że korzystanie z niej gunzipnie zmaksymalizuje możliwości twojego komputera. W tym celu musisz uruchomić wiele gunzips równolegle. Śledzenie, które operacje są wykonywane w tym, który terminal jest ręcznie, jest uciążliwe, ale możesz to łatwo zrobić z GNU równoległym:

find . -name "*.gz" | parallel -X gunzip {}

Nie jest do findtego konieczne użycie , ponieważ nie wspomniano o podfolderach. Co musisz zrobić, to:

for f in *.gz;do gunzip $f;done