Robisz ogólne założenia:
Każdy plik został zapisany dokładnie raz
To nieprawda.
nic nigdy nie zostało usunięte ani przepisane
Również nieprawda.
tylko jeden proces na raz tworzy nowe pliki
Zdecydowanie nieprawda.
Windows to złożony system operacyjny z wieloma procesami i wątkami działającymi jednocześnie, z których wiele zapisuje jednocześnie na dysku twardym, szczególnie podczas instalacji systemu operacyjnego, instalacji aktualizacji i instalacji aplikacji.
Pliki fragmentów występują w dużym stopniu fragmentarycznie, ponieważ są do nich naturalnie dołączane . Współczesny system Windows zapewnia mnóstwo rejestrowania danych, o wiele więcej niż myślisz, dzięki czemu uzyskasz znaczną część fragmentacji, którą widzisz.
Również w przypadku aktualizacji Microsoft stosuje zaawansowaną technologię aktualizacji delta , która łata części plików, co może łatwo doprowadzić do fragmentacji.
Następnie jest usługa optymalizacji .NET, która wstępnie kompiluje zestawy .NET w tle (szczególnie podczas instalacji / aktualizacji .NET). Ta aktywność w tle powoduje fragmentację w miarę trwania innych działań.
Mógłbym tak dalej, ale jestem pewien, że masz pomysł.
Fragmentacja, którą widzisz, jest całkowicie normalna we współczesnym systemie Windows, dlatego dobrą praktyką jest defragmentacja po instalacji systemu operacyjnego na dyskach twardych innych niż SSD.