Nie, Mockito tego nie obsługuje.
To może nie być odpowiedź, której szukasz, ale to, co widzisz, jest symptomem niestosowania zasady projektowania:
Przedkładaj kompozycję nad dziedziczenie
Jeśli wyodrębnisz strategię zamiast rozszerzać superklasę, problem zniknie.
Jeśli jednak nie możesz zmienić kodu, ale i tak musisz go przetestować, w ten niezręczny sposób, nadal jest nadzieja. Za pomocą niektórych narzędzi AOP (na przykład AspectJ) możesz wplecić kod w metodę superklasy i całkowicie uniknąć jej wykonywania (fuj). To nie działa, jeśli używasz proxy, musisz użyć modyfikacji kodu bajtowego (albo splatanie czasu ładowania, albo tkanie czasu kompilacji). Istnieją również frameworki, które obsługują tego typu sztuczki, takie jak PowerMock i PowerMockito.
Proponuję zdecydować się na refaktoryzację, ale jeśli nie jest to opcja, czeka Cię poważna zabawa w hakowanie.