Chcę znaleźć pliki, które kończą się na _peaks.bed, ale wykluczyć pliki w folderach tmpi scripts.

Moje polecenie jest takie:

 find . -type f \( -name "*_peaks.bed" ! -name "*tmp*" ! -name "*scripts*" \)

Ale to nie zadziałało. Pliki w tmpi scriptnadal będą wyświetlane folderu.

Czy ktoś ma jakieś pomysły na ten temat?

Oto jak możesz to określić za pomocą find:

find . -type f -name "*_peaks.bed" ! -path "./tmp/*" ! -path "./scripts/*"

Wyjaśnienie:

• find . - Rozpocznij wyszukiwanie z bieżącego katalogu roboczego (domyślnie rekurencyjnie)
• -type f- Określ, findże chcesz tylko pliki w wynikach
• -name "*_peaks.bed" - Poszukaj plików z nazwą kończącą się na _peaks.bed
• ! -path "./tmp/*" - Wyklucz wszystkie wyniki, których ścieżka zaczyna się od ./tmp/
• ! -path "./scripts/*" - Wyklucz również wszystkie wyniki, których ścieżka zaczyna się od ./scripts/

Testowanie rozwiązania:

$ mkdir a b c d e
$ touch a/1 b/2 c/3 d/4 e/5 e/a e/b
$ find . -type f ! -path "./a/*" ! -path "./b/*"

./d/4
./c/3
./e/a
./e/b
./e/5

Byliście całkiem blisko, -nameopcja uwzględnia tylko podstawową nazwę, gdzie jako -pathrozważa całą ścieżkę =)

Oto jeden sposób, w jaki możesz to zrobić ...

find . -type f -name "*_peaks.bed" | egrep -v "^(./tmp/|./scripts/)"

Posługiwać się

find \( -path "./tmp" -o -path "./scripts" \) -prune -o  -name "*_peaks.bed" -print

lub

find \( -path "./tmp" -o -path "./scripts" \) -prune -false -o  -name "*_peaks.bed"

lub

find \( -path "./tmp" -path "./scripts" \) ! -prune -o  -name "*_peaks.bed"

Kolejność jest ważna. Ocenia od lewej do prawej. Zawsze zaczynaj od wykluczenia ścieżki.

Wyjaśnienie

Nie używaj -not(lub !) do wykluczania całego katalogu. Użyj -prune. Jak wyjaśniono w instrukcji:

−prune    The primary shall always evaluate as  true;  it
          shall  cause  find  not  to descend the current
          pathname if it is a directory.  If  the  −depth
          primary  is specified, the −prune primary shall
          have no effect.

oraz w podręczniku GNU znajdź:

-path pattern
              [...]
              To ignore  a  whole
              directory  tree,  use  -prune rather than checking
              every file in the tree.

Rzeczywiście, jeśli użyjesz -not -path "./pathname", find oceni wyrażenie dla każdego węzła pod "./pathname".

wyrażenia find to tylko ocena warunków.

• \( \)- obsługa grup (możesz użyć -path "./tmp" -prune -o -path "./scripts" -prune -o, ale jest bardziej rozwlekła).
• -path "./script" -prune- jeśli -pathzwraca prawdę i jest katalogiem, zwraca prawdę dla tego katalogu, a nie schodzi do niego.
• -path "./script" ! -prune- ocenia jako (-path "./script") AND (! -prune). Przywraca „zawsze prawdę” śliwki na zawsze fałszywą. Unika drukowania "./script"jako dopasowania.
• -path "./script" -prune -false- ponieważ -prunezawsze zwraca true, możesz wykonać to -falsesamo, co !.
• -o- operator OR. Jeśli żaden operator nie jest określony między dwoma wyrażeniami, domyślnie używany jest operator AND.

W związku z tym \( -path "./tmp" -o -path "./scripts" \) -prune -o -name "*_peaks.bed" -printjest rozszerzany do:

[ (-path "./tmp" OR -path "./script") AND -prune ] OR ( -name "*_peaks.bed" AND print )

Nadruk jest tutaj ważny, ponieważ bez niego jest rozszerzany do:

{ [ (-path "./tmp" OR -path "./script" )  AND -prune ]  OR (-name "*_peaks.bed" ) } AND print

-printjest dodawany przez find - dlatego przez większość czasu nie trzeba go dodawać w swoim wyrażeniu. I od tego czasu-prune zwraca prawdę, wypisze "./script" i "./tmp".

W innych nie jest to konieczne, ponieważ się zmieniliśmy -prune aby zawsze zwracać fałsz.

Wskazówka: możesz użyć, find -D opt expr 2>&1 1>/dev/nullaby zobaczyć, jak jest zoptymalizowany i rozwinięty,
find -D search expr 2>&1 1>/dev/nullaby zobaczyć, która ścieżka jest zaznaczona.

Spróbuj czegoś takiego

find . \( -type f -name \*_peaks.bed -print \) -or \( -type d -and \( -name tmp -or -name scripts \) -and -prune \)

i nie zdziw się, jeśli trochę się pomyliłem. Jeśli celem jest exec (zamiast print), po prostu zastąp go w miejscu.

dla mnie to rozwiązanie nie działało na poleceniu exec z find, naprawdę nie wiem dlaczego, więc moje rozwiązanie jest

find . -type f -path "./a/*" -prune -o -path "./b/*" -prune -o -exec gzip -f -v {} \;

Wyjaśnienie: samo co sampson-chen z dodatkami

-prune - zignoruj ​​ścieżkę proceduralną ...

-o - Następnie, jeśli brak dopasowania, wydrukuj wyniki (wyczyść katalogi i wydrukuj pozostałe wyniki)

18:12 $ mkdir a b c d e
18:13 $ touch a/1 b/2 c/3 d/4 e/5 e/a e/b
18:13 $ find . -type f -path "./a/*" -prune -o -path "./b/*" -prune -o -exec gzip -f -v {} \;

gzip: . is a directory -- ignored
gzip: ./a is a directory -- ignored
gzip: ./b is a directory -- ignored
gzip: ./c is a directory -- ignored
./c/3:    0.0% -- replaced with ./c/3.gz
gzip: ./d is a directory -- ignored
./d/4:    0.0% -- replaced with ./d/4.gz
gzip: ./e is a directory -- ignored
./e/5:    0.0% -- replaced with ./e/5.gz
./e/a:    0.0% -- replaced with ./e/a.gz
./e/b:    0.0% -- replaced with ./e/b.gz

Możesz spróbować poniżej:

find ./ ! \( -path ./tmp -prune \) ! \( -path ./scripts -prune \) -type f -name '*_peaks.bed'