Analiza przestrzenna i grupowanie w pobliżu obiektów


11

Pracuję nad zachowaniem znakowania u żywych zwierząt w grupie i jestem zainteresowany tym, jak pewne cechy sąsiadujących grup wpływają na zachowanie znakowania. Narysowałem terytoria każdej grupy na podstawie izopletów o gęstości 95% utworzonych przy użyciu a-LoCoH. Znaki każdej osoby z grupy są wykreślane jako osobna warstwa punktów. Oznaczanie nie wydaje się losowe i wydają się skupiać wokół granic z sąsiednimi grupami. Co chciałbym zbadać, czy osoby zaznaczają więcej w pobliżu niektórych grup niż w pobliżu innych, na przykład, czy osoby zaznaczają mniej w pobliżu grup, które są blisko spokrewnione? czy można pokazać, że punkty skupiają się w pobliżu niektórych obiektów, ale nie w pobliżu innych?

Każda pomoc, która może być udzielona, ​​byłaby bardzo wdzięczna,

Dave Humphries

##### aktualizacja

Dla celów demonstracyjnych poniżej znajduje się obraz czterech terytoriów (A, B, C i D) oraz lokalizacje oznaczania dwóch osobników z grupy A. Grupy A i B są ze sobą ściśle powiązane. Grupy C i D nie są powiązane z grupą A.

wprowadź opis zdjęcia tutaj


1
Czy jesteś w stanie podać przykładowe dane?
om_henners

Przepraszam, jestem nowy w stosie wymiany - i GIS w tym zakresie, jaki jest standardowy format dostarczania przykładowych danych? Dokument ArcMap?
Dave Humphries

1
Przykładowe dane powinny być publikowane w otwartym formacie GIS czytelnym dla wielu systemów GIS.
markusN

Niektóre z tych plików to pliki kształtów i, jak rozumiem, obecnie nie ma możliwości udostępniania tego typu plików w SE. Z przyjemnością dostarczam przykłady pocztą elektroniczną na adres: david.humphries@mq.edu.au
Dave Humphries

Kolejne pytanie, podczas gdy o tym myślę (wycofaj się z wakacji) - czy granice a-LoCoH powstają z tego samego zbioru danych oznaczania, czy z innego zestawu danych? Z jakiego oprogramowania korzystasz (i czy masz dostęp)?
om_henners

Odpowiedzi:


1

Zdecydowanie polecam przyjrzeć się R , w szczególności pakietowi spatstat z CSRIO. Dostępny jest doskonały podręcznik / samouczek autorstwa prof. Adriana Baddeleya, który przeprowadzi cię przez wiele różnych metod analizy wzoru punktowego. Szczególnie rzuciłbym okiem na Część VII: Wzory Marked Point (szczególnie funkcja korelacji Mark na stronie 202). Uwaga: oznaczenia tutaj odnoszą się do danych klasyfikowanych według atrybutu zamiast relacji numerycznych.

Na początku dokumentu znajduje się również rozdział dotyczący odczytu danych (przy użyciu rgdal , sp itp.). Jeśli używasz ArcGIS, przyjrzałbym się środowisku modelowania geoprzestrzennego jako jeden ze sposobów łączenia danych w R i ArcGIS, w przeciwnym razie QGIS będzie zarządzałR, który zrobiłby to samo.

Wreszcie @whuber (między innymi) tutaj w GIS SE ma ogromną ilość doświadczenia w R, więc zadawaj pytania, gdy je znajdziesz lub spróbuj złapać go na czacie.


Bardzo dziękuję za sugestie. Spróbuję pakietu spatstat i zobaczę, jak idę.
Dave Humphries
Korzystając z naszej strony potwierdzasz, że przeczytałeś(-aś) i rozumiesz nasze zasady używania plików cookie i zasady ochrony prywatności.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.