Równoległa pętla for

Chcę zrównoleglić forpętle poniższego kodu. Jak to zrobić?

#!/bin/bash
N=$1 
n=$2
for (( i=1; i<=$N; i++ )); do
  min=100000000000000  //set min to some garbage value
  for (( j=1; j<=$n; j++ )); do
    val=$(/path/to/a.out)
    val2=`echo $val | bc`  

      if (( $val2 < $min )); then
        min=$val2; 
      fi
  done
  arr=("${arr[@]}" "$min")
done

#!/bin/bash
# set -x # debug version
N=${1:-123}
n=${2:-45}
workers=${workers:-${3:-10}}
((workers < 1)) && ((workers = 1))
((workers > 20)) && ((workers = 20))

((min=100000000000000))  #set min to some garbage value

work() {
  for i in ${*}; do
    for (( j=1; j<=${n}; j++ )); do
      val=$(/path/to/a.out)
      val2=$(echo ${val} | bc)
      (( val2 < min )) && (( min = val2 ));
    done
    echo ${min}
    # # debug version
    # echo ${i} ${j} ${min}
  done
}

# --
arr=($(
  seq ${N} | xargs -n$[N/workers + 1] | while read i; do
    work ${i} &
  done
  wait
))
echo ${arr[*]}
# --

# # debug version
# seq ${N} | xargs -t -n$[N/workers + 1] | while read i; do
#  work ${i} &
# done
# wait

Zawsze używaj pracowników podczas odradzania sparametryzowanej liczby procesów i ogranicz maksymalną liczbę pracowników, którzy mogą się odrodzić .

xargs -n | while read to prosty sposób na iterację list w partiach.

• seq tworzy listę liczb od 1 do N.
• xargs -n dzieli tę listę na N / pracowników + 1 partie.
  • np. N = 100 pracowników = 10 wyprodukuje 10 linii po 11 liczb od 1 do 100.
• while read i czyta każdą linię liczb.
• work ${i} &wywołuje workfunkcję z ${i}partią liczb.

Do debugowania dodałem skomentowany kod debugowania. Po prostu zamień na echowersję do debugowania i kod między # --na wersję do debugowania, a zobaczysz, jak działa na partiach. Odkomentowanie set -xdla bardziej szczegółowego wyniku debugowania, który możesz przekierować do pliku.

Wystarczy uruchomić wersję debugowania z różnymi parametrami, aby zobaczyć, jak działa:

parallel.sh 223 5 1
parallel.sh 223 5 5
parallel.sh 223 5 10
parallel.sh 223 5 20

Oświadczenie: Ten kod nie synchronizuje minwartości między procesami roboczymi. Uzyskanie minimalnej wartości nie jest strasznym ćwiczeniem. Prawdopodobnie zrobi to:

parallel.sh 223 5 20 | tr ' ' '\n' | sort -n | head -1

Lub po prostu dodaj to samo do samego skryptu:

echo ${arr[*]} | tr ' ' '\n' | sort -n | head -1

Korzystanie z GNU Parallel:

#!/bin/bash

N=$1
n=$2

arr=($(
# Generate all combinations of 1..n and 1..N
parallel -k --tag /path/to/a.out {1} {2} '|' bc :::: <(seq $N) <(seq $n) |
  perl -ane 'BEGIN{$min=1e30} $last||=$F[0]; if($F[0] != $last) {print $min,"\n";$min=1e30;$last=$F[0]} $min = $F[2]<$min ? $F[2] : $min; END {print $min,"\n"}'
))
echo ${arr[*]}

To będzie działać /path/to/a.outna każdym procesorze. Dane wyjściowe będą wyglądać następująco:

1 1 19269
1 2 6158
1 3 2794
1 4 25104
2 1 13160
2 2 32683
2 3 12535
2 4 15197
3 1 8228
3 2 7673
3 3 8428
3 4 24463

Skrypt perla sprawdza pierwszą kolumnę i znajduje minimum w trzeciej kolumnie, która ma tę samą pierwszą kolumnę.

Możesz zainstalować GNU Parallel po prostu przez:

wget http://git.savannah.gnu.org/cgit/parallel.git/plain/src/parallel
chmod 755 parallel

Obejrzyj filmy wprowadzające, aby dowiedzieć się więcej: https://www.youtube.com/playlist?list=PL284C9FF2488BC6D1