Apt obsługuje zależności między pakietami zainstalowanymi z repozytoriów lub *.debplików. A co z oprogramowaniem, które użytkownicy skompilowali i zainstalowali ze źródła ./configure && make && make installbez uprzedniego utworzenia .debpliku? Czy to możliwe, że Apt może usunąć pakiety potrzebne przez takie oprogramowanie? Czy instalacja oprogramowania ze źródła /optlub /usr/localcoś zmieniłaby?