Chcę analizować dane poszczególnych kolumn z kilku plików (aprilPlate.txt, mayPlate.txt, junePlate.txt, julyPlate.txt, augustPlate.txt) za pomocą pętli For.
Dane plików wejściowych (aprilPlate.txt, mayPlate.txt, junePlate.txt, julyPlate.txt, augustPlate.txt) wyglądają następująco:
Incl Cal Ps Name Q Con Std Status
True 255 A1 Sample 1 35.86 0
True 255 A2 Sample 2 36.06 0
True 255 A3 Sample 3 17.45 0
True 255 A4 Sample 4 17.56 0
True 255 A5 Sample 5 17.55 0
True 255 A6 Sample 6 40.00 0
True 255 A7 Sample 7 36.38 0
True 255 A8 Sample 8 27.98 0
True 255 A9 Sample 9 27.95 0
True 255 A10 Sample 10 28.19 0
True 255 A11 Sample 11 36.93 0
True 255 A12 Sample 12 37.74 0
True 255 A13 Sample 13 17.88 0
True 255 A14 Sample 14 17.82 0
True 255 A15 Sample 15 17.90 0
.
.
.
Korzystając z pętli FOR, jestem w stanie wykonać zadanie. Jednak aby uzyskać pożądane dane ze wszystkich plików, muszę ręcznie zmodyfikować nazwę pliku w skrypcie (poniżej).
#!/bin/bash
# parse the data of desire columns from target file
# rename the column name
# redirect the stdoutput to a text file
for z in A B;
do for i in 3 4 5 13 14 15;
do grep $z$i aprilPlate.txt |
awk -F "\t" '{print $3 "\t" $5}' |
sed -e 's/A[3-5]/st_SWC/g;s/A[1][0-9]/st_SWD/g;s/B[3-5]/st_TZC/g;s/B[1][0-9]/st_TZD/g;' >> stone.txt;
done;
done
for z in E F;
do for i in 8 9 10 18 19 20;
do grep $z$i aprilPlate.txt |
awk -F "\t" '{print $3 "\t" $5}' |
sed -e 's/E[8-9]\|E[1][0]/su_SWC/g;s/E[1][0-9]\|E[2][0]/su_SWD/g;s/F[8-9]\|F[1][0]/su_TZC/g;s/F[1][0-9]\|F[2][0]/su_TZD/g;' >> suy.txt;
done;
done
paste -d'\t' stone.txt suy.txt >> aprilPlate.data.txt
- Przepraszam, popełniłem błąd w poprzednim kodowaniu. Korekta została wykonana.
Dane wyjściowe przeanalizowanego pliku danych powinny wyglądać następująco:
st_SWC 17.45 su_SWC 28.85
st_SWC 17.56 su_SWC 28.79
st_SWC 17.55 su_SWC 28.82
st_SWD 17.88 su_SWD 29.24
st_SWD 17.82 su_SWD 29.18
st_SWD 17.90 su_SWD 29.23
st_TZC 18.06 su_TZC 25.99
st_TZC 18.09 su_TZC 25.98
st_TZC 18.13 su_TZC 26.02
st_TZD 17.75 su_TZD 25.00
st_TZD 17.70 su_TZD 25.01
st_TZD 17.69 su_TZD 24.98
Chciałbym zapytać, czy w ogóle mogę mieć pliki jako 3. zmienną w skrypcie? Inne rozwiązania są mile widziane.