Jak zainstalować Numpy i Scipy dla Pythona?

Jestem zmęczony próbą zainstalowania numpy i scipy dla phyton 2.7.5, potrzebuję tej wersji Pythona, ponieważ moim ostatecznym celem jest zainstalowanie klasy ( http://class-code.net/ ) i montepython ( http: // montepython .net / ).

(Mam Ubuntu 12.04)

Kiedy próbowałem zaimportować numpy lub scipy, za każdym razem pojawia się następujący błąd:

$ phyton2.7
>>> import numpy
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
  import add_newdocs
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
  from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
  from type_check import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
  import numpy.core.numeric as _nx
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
  import multiarray
ImportError: /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/multiarray.so: undefined        symbol: PyUnicodeUCS4_AsUnicodeEscapeString

>> import scipy
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/__init__.py", line 78, in <module>
  from numpy import show_config as show_numpy_config
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
  import add_newdocs
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
  from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
  from type_check import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
  import numpy.core.numeric as _nx
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
  import multiarray
ImportError: /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/multiarray.so: undefined symbol: PyUnicodeUCS4_AsUnicodeEscapeString

Aby pozbyć się błędu, próbowałem:

1. Spełnij wymagania dla Pythona: $ sudo apt-get install build-essential python-dev gfortran
2. Zainstaluj za pomocą apt-get: $ sudo apt-get install python-numpy python-scipy python-matplotlib ipython ipython-notebook python-pandas python-sympy python-nose
3. Wymagania instalacyjne z pipem: $ sudo pip install requests
4. ... i próbował zainstalować za pomocą pip: $ sudo pip install numpyi$ sudo pip install scipy
5. Mam już środowisko var: export PYTHONPATH=/usr/lib/python2.7/dist-packages:${PYTHONPATH} ostatnia instalacja Numpy i Scipy (w starszej wersji Ubuntu 10.x) działało dla mnie.

6. sudo sh -c "wget http://python-distribute.org/distribute_setup.py -O- | python" sudo sh -c "wget https://raw.github.com/pypa/pip/master/contrib/get-pip.py -O- | python" a następnie zainstaluj oba z pipem jak w (4)

   Ale teraz wygląda na to, że serwer python-distribute.org jest wyłączony. Wystąpił następujący błąd:

   http://python-distribute.org/distribute_setup.py
   Resolving python-distribute.org (python-distribute.org)... failed: Name or service not known.
   wget: unable to resolve host address `python-distribute.org'

7. Próbowałem także zainstalować Numpy i Scipy z centrum oprogramowania Synaptic i Ubuntu

Nie udało mi się przy każdej z tych prób, a teraz nie wiem, co robić. Czy coś brakuje? Jak mogę poprawnie zainstalować Numpy i Scipy dla Pythona? Każdy pomysł zostanie doceniony.

kiedy robię

echo $PYTHONPATH

dostaję

/usr/lib/python2.7/dist-packages

Ok, postępujmy zgodnie z instrukcją instalacji :

1. Mówi, że potrzebujesz Pythona 2.7 (który już masz):

   $ python --version
   Python 2.7.4

2. Następnie mówi, że potrzebujesz również pakietu numpy, wersja> = 1.4.1:

   polityka apt-cache python-numpy
   python-numpy:
   Zainstalowano: (brak)
   Kandydat: 1: 1.7.1-1ubuntu1
   Tabela wersji:
    1: 1.7.1-1ubuntu1 0
       500 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ raring / main amd64 Packages

   Jak widać, mam dostępną wersję Numpy 1.7.1, więc przejdźmy do jej instalacji:

   sudo apt-get install python-numpy

3. Teraz mówi, że potrzebujemy cytonu, sprawdźmy, czy ten pakiet jest dostępny:

   cyton zasad apt-cache
   cyton:
   Zainstalowano: (brak)
   Kandydat: 0,17,4-0ubuntu1
   Tabela wersji:
    0.17.4-0ubuntu1 0
       500 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ raring / main amd64 Packages

   Mamy to, instalujemy:

   sudo apt-get install cython

   Proszę zauważyć, że instalowane są także inne pakiety zależne.

4. Co dziwne, potrzebujemy również modułu Scipy:

   sudo apt-get install python-scipy

5. Testowanie . Otwórz python w terminalu i wpisz następujące polecenie:

   $ python
   Python 2.7.4 (default, Sep 26 2013, 03:20:26) 
   [GCC 4.7.3] on linux2
   Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
   >>> import numpy
   >>> import scipy
   >>> import cython
   >>> exit()

   Powyższe musi być bezbłędne. Jeśli coś poszło nie tak, idź w górę i przeczytaj ponownie przewodnik, zapomniałeś / pominąłeś krok.

6. Pobierając źródła CLASS z ich strony, przejdź do katalogu w terminalu, rozpakuj go i zrób to:

   cd gdzie / the / tar / is
   tar zxf klasa_v2.0.2.tar.gz
   cd klasa_v2.0.2
   robić

   Tutaj poczekamy na zakończenie. Gdy to zrobisz, przejdziemy do katalogu python i uruchomimy magię. Bez przechodzenia z katalogów uruchom to:

   python cd
   Python build.py build
   python setup.py install --user

   Teraz mamy KLASĘ zainstalowaną w naszym katalogu użytkowników. Powinniśmy to przetestować!

   python
   Python 2.7.4 (default, Sep 26 2013, 03:20:26)
   [GCC 4.7.3] on linux2
   Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
   >>> from classy import Class
   >>> exit()

   Do tej pory wszystko jest przytulne.

7. Teraz czas na prawdę, pobierz tarball Monthypython do katalogu kodów:

   cd ~
   kod mkdir
   kod cd
   wget https://www.dropbox.com/s/l7mnhwsktp1m8b5/montepython_v1.2.5.tar.bz2?dl=1 -O montepython_v1.2.5.tar.bz2
   tar jxf montepython_v1.2.5.tar.bz2

   W instrukcjach instalacji znajduje się kilka uwag , które nie są istotne w tym szczególnym przypadku (nowa instalacja), ale może być ważne podczas aktualizacji montepython.

8. Ta zmiana jest ważna. Pamiętasz, gdzie zainstalowałeś CLASS? Teraz powinieneś powiedzieć Monte Python, gdzie to jest. W moim przypadku /home/braiam/src/class_v2.0.2/classtwój może być inny. Możesz użyć, findaby poszukać:

   find ~ -name class -print

   Cóż, teraz modyfikuję default.confplik, używając tego, co chcesz (użyję nano) i modyfikuję rootścieżkę, aby cały plik wyglądał następująco:

   # Fill in the relevant path to your personal distribution. 
   # If you create a new file out of this one, please remember to call
   # MontePython.py with the option '-conf my.conf'
   
   # At minimum, this file should contain one line:
   # ** path['cosmo'] =  path to the cosmological code you are using. Note, if you are
   # using a modified version of class, be sure that the path contains the word
   # class, otherwise the code might not recognise it.
   
   # If you want to use a data folder different from the one present in the folder
   # you are executing the code, please also add:
   # ** path['data']  =  /path/to/the/other/data/
   
   root = '/home/braiam/src/class_v2.0.2/'
   
   path['cosmo']           = root+'/class/'

   Zapisz plik i wyjdź.

9. Przetestuj montepython! Jeśli wszystko było w porządku, powinieneś być w stanie uruchomić code/MontePython.py --helpw swoim katalogu montepythong i wszystko powinno działać:

   ~ / src / montepython $ code / MontePython.py --help
   użycie: MontePython.py [-h] [-N liczba kroków] [-o folder wyjściowy]
                     [-p wejściowy plik parametrów] [-c wejściowa macierz cov]
                     [-j metoda skakania] [-f współczynnik skoku]
                     [plik konfiguracyjny -conf] [numer łańcucha -chain]
                     [-r restart z łańcucha] [-bf restart z pliku najlepszego dopasowania]
                     [-info [oblicz informacje o żądanym pliku [oblicz informacje o żądanym pliku ...]]]
                     [-bins pożądaną liczbę binów, domyślnie jest to 20] [-no_mean]
                     [-comp folder porównawczy]
                     [-extra plik wykresu na potrzeby niestandardowe] [-noplot] [-all]
                     [-rozszerzenie zmiany tekstu dla pliku wyjściowego]
                     [-fontsize żądany rozmiar czcionki, domyślnie 15]
                     [-typowy żądany rozmiar tyknięcia, domyślnie 13]
   
   Monte Python, kod Monte Carlo w Pythonie
   
   
   opcjonalne argumenty:
   -h, --help pokaż ten komunikat pomocy i wyjdź
   -N liczba kroków
   -o folder wyjściowy
   -p wejściowy plik parametrów
   -c wejściowa macierz cov
   -j metoda skakania
   -f współczynnik skoku
   -conf plik konfiguracyjny
   -numer_ łańcuchu
   -r uruchom ponownie z łańcucha
   -bf uruchom ponownie od pliku najlepszego dopasowania
   -info [oblicz informacje o żądanym pliku [oblicz dane o żądanym pliku ...]]
   -bins pożądana liczba binów, domyślnie 20
   -bez znaczenia
   -comp folder porównawczy
   -extra plik wykresu do własnych potrzeb
   -noplot
   -wszystko
   -ext zmiana rozszerzenia pliku wyjściowego
   -fontsize żądany rozmiar czcionki, domyślnie 15
   -ticksize pożądany tyknięcie, domyślnie 13

Dzięki temu masz zainstalowany montepython i gotowy do użycia!