Po zainstalowaniu biblioteki geos (C ++ i C), a następnie próbie zainstalowania pakietu rgeos (R), zgłasza brak geos-config!


9

Wiedząc, że pakiet rgeos z języka R wymaga wcześniejszej instalacji bibliotek geos, zainstalowałem zarówno libgeos, jak i libgeos-c1 (3.2.2), korzystając z instalatora synaptycznego na moim komputerze Ubuntu 12.04 (32-bitowym).

Następnie próbowałem zainstalować rgeos bezpośrednio z konsoli R. Wydało to komunikat w tym sensie, że nie znaleziono geos-config. Dane wyjściowe są następujące:

> install.packages("rgeos")
Installing package(s) into ‘/home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15’
(as ‘lib’ is unspecified)
also installing the dependency ‘sp’

probando la URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/sp_1.0-9.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 882102 bytes (861 Kb)
URL abierta
==================================================
downloaded 861 Kb

probando la URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/rgeos_0.2-19.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 221471 bytes (216 Kb)
URL abierta
==================================================
downloaded 216 Kb

* installing *source* package ‘sp’ ...
** package ‘sp’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c R    centroid.c -o Rcentroid.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c gcdist.c -o gcdist.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c init.c -o init.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c pip.c -o pip.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c pip2.c -o pip2.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c sp_xports.c -o sp_xports.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c surfaceArea.c -o surfaceArea.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O3 -pipe  -g  -c zerodist.c -o zerodist.o
gcc -std=gnu99 -shared -o sp.so Rcentroid.o gcdist.o init.o pip.o pip2.o sp_xports.o surfaceArea.o zerodist.o -L/usr/lib/R/lib -lR
installing to /home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15/sp/libs
** R
** data
** demo
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
   ‘intro_sp.Rnw’ 
   ‘over.Rnw’ 
** testing if installed package can be loaded

* DONE (sp)
* installing *source* package ‘rgeos’ ...
** package ‘rgeos’ successfully unpacked and MD5 sums checked
configure: CC: gcc -std=gnu99
configure: CXX: g++
configure: rgeos: 0.2-17
checking for /usr/bin/svnversion... no
configure: svn revision: 394
checking geos-config usability... 
./configure: line 1385: geos-config: command not found
no
configure: error: geos-config not usable
ERROR: configuration failed for package ‘rgeos’
* removing ‘/home/checo/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.15/rgeos’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘rgeos’ had non-zero exit status

Wybacz moją ignorancję, ale nie wiem, skąd pochodzi ten plik „geos-config”: czy powinien zostać wygenerowany przez powyższe kompilacje gcc, czy też powinien zostać wcześniej zainstalowany, gdy biblioteki libgeos zostały zainstalowane?

Na innym komputerze dowiedziałem się, że „geos-config” jest plikiem wykonywalnym i że powinien zostać zainstalowany w / usr / bin.

Czy masz pojęcie, co jest nie tak z moją procedurą?

Dzięki,

-Sergio.

Odpowiedzi:


14

Zainstaluj pakiet libgeos-devZainstaluj libgeos-dev ze swoim ulubionym menedżerem pakietów (lub centrum oprogramowania), a będziesz mieć /usr/bin/geos-config.

Jak to znalazłem? Użyłem zapytania geos-configdotyczącego plików na stronie http://packages.ubuntu.com/ . Spowoduje to wyświetlenie potrzebnego pakietu ( link zapytania ). Użyj tego następnym razem, gdy napotkasz podobne problemy!


2
Możesz także użyć miłego narzędzia apt-filedo wyszukiwania plików w repozytorium ubuntu. Na przykład. apt-file search geos-configda ci dokładne dopasowanie do libgeos-dev.
ortang

Dzięki! Zrobiłem zgodnie z zaleceniami, a pakiet R „rgeos” również został zainstalowany bez problemu.
JulioSergio,

2

Ponieważ OP nie podaje konkretnej dystrybucji, oto linia, której potrzebowałem, aby zainstalować go-config na CENTOS (np. RHEL i Amazon Linux): yum install -y geos-devel

Korzystając z naszej strony potwierdzasz, że przeczytałeś(-aś) i rozumiesz nasze zasady używania plików cookie i zasady ochrony prywatności.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.