Udało mi się sprawić, że wbudowany mikrofon (jest to laptop Acer) nie tylko działa, ale działa doskonale we własnym rejestratorze dźwięku Ubuntu, ale podczas uruchamiania Skype'a nie ma w ogóle śladu mojego mikrofonu.
Ponownie zainstalowałem Skype, sprawdziłem ALSAmixer i wypróbowałem różne ustawienia.