Odpowiedzi:
Zakładając, że komputer zdalny jest skrzynką Windows (a także zakładając, że robisz nowe logowanie za każdym razem, gdy się łączysz, a nie tylko łączysz się z istniejącą sesją (czy jest to traktowane jako RDP?)), Nie możesz po prostu dodać skrótu do program w folderze startowym?
http://windows.microsoft.com/en-us/windows/run-program-automatically-windows-starts#1TC=windows-7
Jeśli nie używasz systemu Windows, który oczywiście nie pomoże. Tak czy inaczej, musisz podać więcej szczegółów.