Kill program po tym, jak wypisze dany wiersz ze skryptu powłoki

Tło:

Piszę skrypt testowy dla oprogramowania biologii obliczeniowej. Oprogramowanie, które testuję, może trwać kilka dni, a nawet tygodni, więc ma wbudowane funkcje odzyskiwania w przypadku awarii systemu lub awarii zasilania.

Próbuję wymyślić, jak przetestować system odzyskiwania. W szczególności nie mogę znaleźć sposobu na „zawieszenie” programu w kontrolowany sposób. Zastanawiałem się nad czasem, aby rozkaz SIGKILL działał po pewnym czasie. Prawdopodobnie nie jest to idealne rozwiązanie, ponieważ nie gwarantuje się, że przypadek testowy będzie działał z tą samą prędkością za każdym razem (działa we wspólnym środowisku), więc porównanie dzienników z pożądanymi danymi wyjściowymi byłoby trudne.

To oprogramowanie drukuje wiersz dla każdej sekcji analizy, którą wykonuje.

Pytanie:

Zastanawiałem się, czy istnieje dobry / elegancki sposób (w skrypcie powłoki), aby przechwycić dane wyjściowe z programu, a następnie zabić program, gdy dany wiersz / liczba wierszy jest wysyłana przez program?

Skrypt otoki taki jak ten jest standardowym podejściem. Skrypt uruchamia program w tle, a następnie zapętla, sprawdzając plik dziennika co minutę pod kątem jakiegoś ciągu. Jeśli ciąg zostanie znaleziony, program w tle zostanie zabity i skrypt zostanie zamknięty.

command="prog -foo -whatever"
log="prog.log"
match="this is the what i want to match"

$command > "$log" 2>&1 &
pid=$!

while sleep 60
do
    if fgrep --quiet "$match" "$log"
    then
        kill $pid
        exit 0
    fi
done

Jeśli twój program zakończy działanie na SIGPIPE (co jest domyślną akcją), powinno wystarczyć przekierowanie wyjścia do czytnika, który wyjdzie po przeczytaniu tego wiersza.

Może to być tak proste jak

$ program | sed -e '/Suitable text from the line/q'

Jeśli chcesz ukryć domyślne wyjście, użyj

$ program | sed -n -e '/Suitable text from the line/q'

Podobnie, jeśli chce się zatrzymać po określonej liczbie linii, można użyć głowy zamiast sed, np

$ program | head -n$NUMBER_OF_LINES_TO_STOP_AFTER

Dokładny czas, w którym nastąpi zabójstwo , zależy od buforowania zachowania terminala, jak sugeruje stardt w komentarzach.

Alternatywą dla odpowiedzi dmckee jest także greppolecenie z -mopcją (patrz np. Ta strona podręcznika ):

compbio | grep -m 1 "Text to match"

zatrzymać, gdy zostanie znaleziony 1 wiersz pasujący do tekstu lub

compbio | grep -v -m 10 "Text to match"

czekać na 10 wierszy, które nie pasują do podanego tekstu.

Możesz użyć expect(1)do obejrzenia standardowego programu, a następnie wykonać predefiniowane działanie na niektórych wzorcach.

#!/usr/bin/env expect

spawn your-program -foo -bar 
expect "I want this text" { close }

Lub linijka do osadzenia w innym skrypcie:

expect -c "spawn your-program -foo -bar; expect \"I want this text\" { close }"

Pamiętaj, że expectpolecenie nie jest domyślnie dostarczane z każdym systemem operacyjnym. Może być konieczne jego zainstalowanie.

Możesz użyć instrukcji „while”:

Musisz przesłać dane wyjściowe swojego oprogramowania (lub jego dzienników), a następnie, dla każdej nowej linii, wykonać test warunkowy, a następnie uruchomić polecenie kill -KILL. Na przykład (testowałem z plikiem / var / log / messages jako plikiem dziennika):

tail -f /var/log/messages | while read line; do test "$line" = "THE LINE YOU WANT TO MATCH" && kill PIDTOKILL; done

Lub bezpośrednio z oprogramowaniem:

./biosoftware | while read line; do test "$line" = "THE LINE YOU WANT TO MATCH" && kill PIDTOKILL; done

Musisz zastąpić ścieżkę dziennika / nazwę aplikacji, pasujący wiersz i PID do zabicia (możesz także użyć killall).

Powodzenia w oprogramowaniu,

Hugo,