Terminologia prawdopodobnie nie jest stosowana konsekwentnie, dlatego poniżej rozumiem tylko oryginalne pytanie. Z mojego rozumienia, obliczone przez ciebie normalne CI nie są tym, o co cię proszono. Każdy zestaw replik ładowania początkowego daje jeden przedział ufności, nie wiele. Sposób obliczania różnych typów CI na podstawie wyników zestawu replik ładowania początkowego jest następujący:
B <- 999 # number of replicates
muH0 <- 100 # for generating data: true mean
sdH0 <- 40 # for generating data: true sd
N <- 200 # sample size
DV <- rnorm(N, muH0, sdH0) # simulated data: original sample
Ponieważ chcę porównać obliczenia z wynikami z pakietu boot
, najpierw definiuję funkcję, która będzie wywoływana dla każdej replikacji. Jego argumentami są oryginalna próbka oraz wektor indeksu określający przypadki dla pojedynczej repliki. Zwraca , oszacowanie wtyczki dla , a także , oszacowanie wtyczki dla wariancji średniej . Ten ostatni będzie wymagany tylko w przypadku bootstrap -CI. μ S 2 ⋆ M σ 2 M tM.⋆μS.2 ⋆M.σ2)M.t
> getM <- function(orgDV, idx) {
+ bsM <- mean(orgDV[idx]) # M*
+ bsS2M <- (((N-1) / N) * var(orgDV[idx])) / N # S^2*(M)
+ c(bsM, bsS2M)
+ }
> library(boot) # for boot(), boot.ci()
> bOut <- boot(DV, statistic=getM, R=B)
> boot.ci(bOut, conf=0.95, type=c("basic", "perc", "norm", "stud"))
BOOTSTRAP CONFIDENCE INTERVAL CALCULATIONS
Based on 999 bootstrap replicates
CALL :
boot.ci(boot.out = bOut, conf = 0.95, type = c("basic", "perc", "norm", "stud"))
Intervals :
Level Normal Basic Studentized Percentile
95% ( 95.6, 106.0 ) ( 95.7, 106.2 ) ( 95.4, 106.2 ) ( 95.4, 106.0 )
Calculations and Intervals on Original Scale
Bez użycia pakietu boot
możesz po prostu użyć, replicate()
aby uzyskać zestaw replik ładowania początkowego.
boots <- t(replicate(B, getM(DV, sample(seq(along=DV), replace=TRUE))))
Ale trzymajmy się wyników z, boot.ci()
aby mieć referencję.
boots <- bOut$t # estimates from all replicates
M <- mean(DV) # M from original sample
S2M <- (((N-1)/N) * var(DV)) / N # S^2(M) from original sample
Mstar <- boots[ , 1] # M* for each replicate
S2Mstar <- boots[ , 2] # S^2*(M) for each replicate
biasM <- mean(Mstar) - M # bias of estimator M
Podstawowy, percentyl i CI polegają na empirycznym rozkładzie oszacowań bootstrap. Aby uzyskać kwantyle i , znajdujemy odpowiadające indeksy posortowanemu wektorowi oszacowań bootstrap (zauważ, że wykona bardziej skomplikowaną interpolację w celu znalezienia kwantyli empirycznych, gdy indeksy nie są liczbami naturalnymi) .α / 2 1 - α / 2tα / 21 - α / 2boot.ci()
(idx <- trunc((B + 1) * c(0.05/2, 1 - 0.05/2)) # indices for sorted vector of estimates
[1] 25 975
> (ciBasic <- 2*M - sort(Mstar)[idx]) # basic CI
[1] 106.21826 95.65911
> (ciPerc <- sort(Mstar)[idx]) # percentile CI
[1] 95.42188 105.98103
Dla -CI potrzebujemy oszacowań bootstrap, aby obliczyć krytyczne wartości . Dla standardowego normalnego CI, wartość krytyczna będzie po prostu być -value od rozkładu normalnego.t ⋆ t ztt⋆tz
# standard normal CI with bias correction
> zCrit <- qnorm(c(0.025, 0.975)) # z-quantiles from std-normal distribution
> (ciNorm <- M - biasM + zCrit * sqrt(var(Mstar)))
[1] 95.5566 106.0043
> tStar <- (Mstar-M) / sqrt(S2Mstar) # t*
> tCrit <- sort(tStar)[idx] # t-quantiles from empirical t* distribution
> (ciT <- M - tCrit * sqrt(S2M)) # studentized t-CI
[1] 106.20690 95.44878
Aby oszacować prawdopodobieństwo pokrycia tych typów CI, będziesz musiał uruchomić tę symulację wiele razy. Po prostu zawiń kod do funkcji, zwróć listę z wynikami CI i uruchom go z replicate()
podobną demonstracją w tej liście .
size=100
literówka? Nie sądzę, aby uzyskać właściwe górne i dolne granice, ponieważ domyślna wielkość próby wydaje się wynosić 1000, gdy obliczasz swoje CI w pętli (ponieważ używaszsqrt.n
do obliczeń). Ponadto, dlaczego porównujeszmu
bezpośrednio 0, a nie 0 (ten ostatni jest prawdziwym środkiem)?