R: dynamicznie aktualizuj wykres [zamknięty]

To jest pytanie dotyczące wizualizacji danych. Mam bazę danych, która zawiera niektóre dane, które są stale aktualizowane (aktualizacja online). Jaki jest najlepszy sposób w R na aktualizowanie wykresu co powiedzmy 5 lub 10 sekund. (bez ponownego spisku wszystko jest możliwe)?

fRed

r data-visualization

— RockScience
źródło

Odpowiedzi:

Zakładając, że chcesz zaktualizować R windows()lub x11()wykres, możesz używać funkcji takich jak points()i, lines()aby dodawać nowe punkty lub przedłużać linie na wykresie bez przerysowywania; zauważ jednak, że nie zmieni to zakresu osi, aby uwzględnić punkty, które mogą zniknąć z pola widzenia. Zasadniczo dobrym pomysłem jest natychmiastowe sporządzenie wykresu - na przykład poprzez przeniesienie wysiłku obliczeniowego na wykonanie mniejszej reprezentacji środkowej, którą można narysować szybko, np. Mapę gęstości zamiast dużej liczby punktów lub zmniejszenie rozdzielczości wykresów liniowych ( może to być skomplikowane).

Aby wstrzymać sesję R przez określony czas bez zajętego oczekiwania, użyj Sys.sleep().

(+1) Zapomniałem Sys.sleep()funkcji. Myślę że

x

$x$ - i

y

$y$ - zakres osi powinien być ustalony wcześniej, nie?

— chl

@chl, tak

x

$x$ i

y

$y$ zakresy osi należy wcześniej ustalić.

— mpiktas

@mpiktas Lub po prostu zainicjuj fabułę za pomocą jednego wywołania plot(), być może z tym, 0,0,type="n"że nie ma jeszcze nic do wykreślenia ... Rzeczywiście jest to o wiele łatwiejsze niż pisanie plot.new()i dodawanie ręcznie takich rzeczy jak osie lub etykiety.

Rzeczywiście wydaje się to najprostsze ... ale szkoda, że osie nie są aktualizowane. Ponieważ chcę aktualizować online szereg czasowy i wiem, z jaką prędkością porusza się oś x, wydaje mi się, że mogę powtórzyć wszystko co n aktualizacji.

— RockScience

W przypadku wizualizacji offline możesz generować pliki PNG i konwertować je na animowane pliki GIF za pomocą ImageMagick . Użyłem go do demonstracji (przerysowałem jednak wszystkie dane):

source(url("http://aliquote.org/pub/spin_plot.R"))
dd <- replicate(3, rnorm(100))
spin.plot(dd)

Generuje to kilka plików PNG z prefiksem fig. Następnie na powłoce un * x

convert -delay 20 -loop 0 fig*.png sequence.gif

daje tę animację (inspirowaną nowoczesnymi metodami biostatystycznymi stosowanymi przez S-Plus , S. Selvin, 1998):

alternatywny tekst

Inną opcją, która wygląda o wiele bardziej obiecująco, jest poleganie na pakiecie animacji . Istnieje przykład z automatyczną regresją ruchomego okna, która powinna pozwolić Ci zacząć.

— chl
źródło