Podczas modelowania ciągłych proporcji (np. Proporcjonalna pokrywa roślinności w kwadratowych badaniach lub odsetek czasu poświęconego na działanie) regresja logistyczna jest uważana za nieodpowiednią (np. Warton i Hui (2011). Arcsine jest asinine: analiza proporcji w ekologii ). Raczej regresja OLS po przekształceniu logitów proporcji, a może regresja beta, są bardziej odpowiednie.
W jakich warunkach szacunki współczynników regresji logit-liniowej i regresji logistycznej różnią się przy zastosowaniu R lmi glm?
Weźmy następujący symulowany zestaw danych, w którym możemy założyć, że psą to nasze surowe dane (tj. Ciągłe proporcje, zamiast reprezentować ):
set.seed(1)
x <- rnorm(1000)
a <- runif(1)
b <- runif(1)
logit.p <- a + b*x + rnorm(1000, 0, 0.2)
p <- plogis(logit.p)
plot(p ~ x, ylim=c(0, 1))

Dopasowując model logit-liniowy, otrzymujemy:
summary(lm(logit.p ~ x))
##
## Call:
## lm(formula = logit.p ~ x)
##
## Residuals:
## Min 1Q Median 3Q Max
## -0.64702 -0.13747 -0.00345 0.15077 0.73148
##
## Coefficients:
## Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)
## (Intercept) 0.868148 0.006579 131.9 <2e-16 ***
## x 0.967129 0.006360 152.1 <2e-16 ***
## ---
## Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
##
## Residual standard error: 0.208 on 998 degrees of freedom
## Multiple R-squared: 0.9586, Adjusted R-squared: 0.9586
## F-statistic: 2.312e+04 on 1 and 998 DF, p-value: < 2.2e-16
Regresja logistyczna daje:
summary(glm(p ~ x, family=binomial))
##
## Call:
## glm(formula = p ~ x, family = binomial)
##
## Deviance Residuals:
## Min 1Q Median 3Q Max
## -0.32099 -0.05475 0.00066 0.05948 0.36307
##
## Coefficients:
## Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)
## (Intercept) 0.86242 0.07684 11.22 <2e-16 ***
## x 0.96128 0.08395 11.45 <2e-16 ***
## ---
## Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
##
## (Dispersion parameter for binomial family taken to be 1)
##
## Null deviance: 176.1082 on 999 degrees of freedom
## Residual deviance: 7.9899 on 998 degrees of freedom
## AIC: 701.71
##
## Number of Fisher Scoring iterations: 5
##
## Warning message:
## In eval(expr, envir, enclos) : non-integer #successes in a binomial glm!
Czy oszacowania współczynnika regresji logistycznej zawsze będą obiektywne w stosunku do oszacowań modelu logit-liniowego?
family=binomialimplikuje, że zmienna zależna reprezentuje liczby dwumianowe - a nie proporcje. A skąd miałby glmwiedzieć, że 0.1to jest jak „jeden na dziesięć”, a nie „dziesięć na sto”? Chociaż sama proporcja nie różni się, ma to poważne implikacje dla sposobu obliczania błędu standardowego.
weightsargument zawierający liczbę prób do arg (chociaż nie tego próbowałem w swoim poście, w którym celowo analizowałem dane niepoprawnie).
0.1„było”, powiedzmy, 10 niezależnych prób dających jeden sukces. Dla modelu liniowego0.1jest po prostu wartością, jakąś arbitralną miarą.