matplotlib / seaborn: pierwszy i ostatni rząd przecięty na pół działki mapy cieplnej

Podczas kreślenia map ciepła z porostem morskim (i macierzami korelacji z matplotlib) pierwszy i ostatni wiersz przecina się na pół. Dzieje się tak również, gdy uruchamiam ten minimalny przykład kodu, który znalazłem w Internecie.

import pandas as pd
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt

data = pd.read_csv('https://raw.githubusercontent.com/resbaz/r-novice-gapminder-files/master/data/gapminder-FiveYearData.csv')
plt.figure(figsize=(10,5))
sns.heatmap(data.corr())
plt.show()

Etykiety na osi y znajdują się we właściwym miejscu, ale rzędy nie są tam całkowicie.

Kilka dni temu działało zgodnie z przeznaczeniem. Od tego czasu zainstalowałem texlive-xetex, więc ponownie go usunąłem, ale nie rozwiązało to mojego problemu.

Jakieś pomysły, czego mógłbym brakować?

Niestety matplotlib 3.1.1 zepsuł mapy cieplne dotyczące dna morskiego ; i ogólnie odwrócone osie ze stałymi znacznikami.
Zostało to naprawione w bieżącej wersji rozwojowej; możesz stąd

• powróć do matplotlib 3.1.0
• użyj matplotlib 3.1.2 lub nowszej
• ustaw ręcznie limity mapy cieplnej ( ax.set_ylim(bottom, top) # set the ylim to bottom, top)

Jest to błąd w regresji matplotlib między 3.1.0 a 3.1.1 Możesz to naprawić przez:

import seaborn as sns
df_corr = someDataFrame.corr()
ax = sns.heatmap(df_corr, annot=True) #notation: "annot" not "annote"
bottom, top = ax.get_ylim()
ax.set_ylim(bottom + 0.5, top - 0.5)

Naprawiono korzystanie z powyższego i ręczne ustawianie limitów mapy cieplnej.

Pierwszy

ax = sns.heatmap(...

sprawdził aktualne osie za pomocą

ax.get_ylim()
(5.5, 0.5)

Naprawiono za pomocą

ax.set_ylim(6.0, 0)

Rozwiązałem to, dodając tę ​​linię w moim kodzie, z matplotlib==3.1.1:

ax.set_ylim(sorted(ax.get_xlim(), reverse=True))

NB. Jedynym powodem, dla którego to działa, jest to, że oś X nie jest zmieniona, więc używaj na własne ryzyko z przyszłymi wersjami mpl

Matplotlib 3.1.2 jest niedostępny - jest dostępny w chmurze Anaconda przez conda-forge, ale nie udało mi się go zainstalować przez conda install. Ręczna alternatywa zadziałała: Pobierz matplotlib 3.1.2 z github i zainstaluj przez pip

 % curl https://codeload.github.com/matplotlib/matplotlib/tar.gz/v3.1.2 --output matplotlib-3.1.2.tar.gz
 % pip install matplotlib-3.1.2.tar.gz

Zdarza się, ze matplotlib wersji 3.1.1 jak sugeruje importanceofbeingernest

Następujące rozwiązało mój problem

pip install matplotlib==3.1.0

rustyDev ma rację co do Conda-Forge, ale nie musiałem wykonywać ręcznej instalacji pip z Githuba. U mnie w systemie Windows działało bezpośrednio. I znowu wszystko jest ładne.

https://anaconda.org/conda-forge/matplotlib

conda install -c conda-forge matplotlib

punkty opcjonalne, niepotrzebne do odpowiedzi:

Potem wypróbowałem inne kroki, ale nie są one potrzebne: W zachęcie conda: wyszukiwanie conda matplotlib --info nie pokazało żadnych informacji o nowej wersji, najnowsze informacje dotyczyły wersji 3.1.1. Dlatego próbowałem użyć pip, pip install matplotlib==3.1.2ale pip mówi: „Wymaganie już spełnione”

Uzyskanie wersji zgodnej z medium.com/@rakshithvasudev/… python - import matplotlib - matplotlib.__version__pokazuje, że 3.1.2 został pomyślnie zainstalowany

Przy okazji, miałem ten błąd bezpośrednio po aktualizacji Spydera do wersji 4.0.0. Błąd tkwił w wykresie macierzy pomyłki. Wspomniano o tym już kilka miesięcy temu. stackoverflow.com/questions/57225685/…, który jest już powiązany z tym pytaniem dotyczącym gatunku morskiego.

conda install matplotlib = 3.1.0

To zadziałało dla mnie i obniżyłem matplotlib z 3.1.1 do 3.1.0, a mapy popularności zaczęły zachowywać się poprawnie

Rozwiązałem ten problem za pomocą następującego kodu: