„RuntimeError: Upewnij się, że pliki wykonywalne Graphviz znajdują się na ścieżce Twojego systemu” po zainstalowaniu Graphviz 2.38

Ściągnąłem Graphviz 2.38wersję MSI i zainstalowany w folderze C:\Python34, a następnie uruchomić pip install Graphviz, wszystko poszło dobrze. W ścieżce systemu dodałem C:\Python34\bin. Kiedy próbowałem uruchomić skrypt testowy filename=dot.render(filename='test'), otrzymałem komunikat

 RuntimeError: failed to execute ['dot', '-Tpdf', '-O', 'test'], make sure the Graphviz executables are on your systems' path

Próbowałem wprowadzić "C:\Python34\bin\dot.exe"ścieżkę systemową, ale to nie zadziałało, a nawet utworzyłem nową zmienną środowiskową "GRAPHVIZ_DOT"z wartością "C:\Python34\bin\dot.exe", która nadal nie działa. Próbowałem odinstalować Graphviz pip uninstall graphviz, a następnie zainstalować go ponownie i ponownie zainstalować pip, ale nic nie działa.

Cała wiadomość śledzenia zwrotnego to:

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Python34\lib\site-packages\graphviz\files.py", line 220, in render
    proc = subprocess.Popen(cmd, startupinfo=STARTUPINFO)
  File "C:\Python34\lib\subprocess.py", line 859, in __init__
    restore_signals, start_new_session)
  File "C:\Python34\lib\subprocess.py", line 1112, in _execute_child
    startupinfo)
FileNotFoundError: [WinError 2] The system cannot find the file specified

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Users\Documents\Kissmetrics\curves and lines\eventNodes.py", line 56, in <module>
    filename=dot.render(filename='test')
  File "C:\Python34\lib\site-packages\graphviz\files.py", line 225, in render
    'are on your systems\' path' % cmd)
RuntimeError: failed to execute ['dot', '-Tpdf', '-O', 'test'], make sure the Graphviz executables are on your systems' path

Czy ktoś ma z tym jakieś doświadczenie?

Powinieneś zainstalować pakiet graphviz w swoim systemie (nie tylko pakiet Pythona). Na Ubuntu powinieneś spróbować:

sudo apt-get install graphviz

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'D:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/'

W oknach po prostu dodaj te 2 linie na początku, gdzie „D: / Program Files (x86) /Graphviz2.38/bin/” jest zastępowane adresem, w którym znajduje się plik bin.

To rozwiązuje problem.

Ten rozwiązał problem na MAC :

  brew install graphviz

Dla Windowsa:

1. Zainstaluj pakiet Windows z: https://graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html
2. Zainstaluj graphvizpakiet Pythona
3. Dodaj C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bindo ścieżki użytkownika
4. Dodaj C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin\dot.exedo ścieżki systemowej

To zadziałało dla mnie!

Spróbuj użyć:

conda install python-graphviz

Plik wykonywalny graphviz znajduje się na innej ścieżce niż katalog conda, jeśli używasz pip install graphviz.

OSX Sierra, Python 2.7, Graphviz 2.38

Korzystanie pip install graphviziconda install graphviz OBIE rozwiązuje problem.

pippojawia się tylko problem ze ścieżką taki sam jak twój i pojawia się condatylko błąd importu.

Krok 1: Zainstaluj plik binarny Graphviz

Okna:

1. Pobierz Graphviz z http://www.graphviz.org/download/
2. Dodaj poniżej do zmiennej środowiskowej PATH (wspomnij o zainstalowanej wersji graphviz):
   • C: \ Program Files (x86) \ Graphviz2.38 \ bin
   • C: \ Program Files (x86) \ Graphviz2.38 \ bin \ dot.exe
3. Zamknij dowolny otwarty notatnik Juypter i wiersz poleceń
4. Uruchom ponownie monit Jupyter / cmd i przetestuj

Linux:

1. sudo apt-get update
2. sudo apt-get install graphviz
3. lub utwórz go ręcznie z http://www.graphviz.org/download/

Krok 2: Zainstaluj moduł graphviz dla Pythona

pypeć:

• pip install graphviz

conda:

• conda zainstaluj graphviz

Wystarczy dodać poniżej do zmiennej środowiskowej (system) PATH w systemie Windows

C: \ Program Files (x86) \ Graphviz2.38 \ bin

tam można znaleźć pliki .exe

Jeśli nie działa

Znajdź folder Graphviz2.38 / bin w swoim Program Files, a nie w python lib

Następnie dodaj do swojej PATH

Ważne jest, aby znaleźć folder, w którym istnieją pliki .exe

Spróbuj conda install graphviz. Miałem ten sam problem, rozwiązałem go wspomnianym poleceniem w MacOS.

Używając conda install graphvizi conda install python-graphvizinstalując GraphViz na Windows10, potrzebna ścieżka to C: / ProgramData / Anaconda3 / Library / bin / graphviz / for me. Tj. Dodawanie

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/ProgramData/Anaconda3/Library/bin/graphviz/'

rozwiązał problem za mnie.

conda install python-graphviz

W przypadku systemu Windows zainstaluj Python Graphviz, który będzie zawierał pliki wykonywalne w ścieżce.

W systemie Ubuntu Linux rozwiązało to dla mnie:

pip install graphviz
sudo apt-get install graphviz

Możesz także spróbować conda install -c conda-forge graphvizzamiast pip, jeśli używasz Anacondy.

Rozwiązując ten problem samodzielnie, skorzystałem z tego samouczka GitHub , który przeanalizował przyczynę tego problemu. Jeśli czytamy między wierszami, mówi się, że potrzebuje systemu, a także wykresu Pythona . Oprócz conda installtego musielibyśmy uruchomić:

conda install -c conda-forge python-graphviz

Następnie zrestartuj jądro; To działa jak urok.

Jestem na macOS Catalina 10.15.3 i miałem podobny błąd: ExecutableNotFound: failed to execute ['dot', '-Tsvg'], make sure the Graphviz executables are on your systems' PATH

Naprawiono to za pomocą:

pip3 install graphviz I brew install graphviz

Zwróć uwagę, że pip3 installzwróci tylko komunikat o powodzeniu, Successfully installed graphviz-0.13.2więc nadal musimy uruchomić, brew installaby uzyskać Graphviz 2.42.3 (od 10 marca 2020 r., 18:00).

1) Graphviz - pobierz, rozpakuj w określonym miejscu w systemie (pip nie działa w systemie Windows) i umieść folder bin w ścieżce („ustaw zmienne środowiskowe w oknach” LUB) ustawioną ręcznie w każdym programie

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/GraphViz/bin'

2) Następnie umieść model na wykresie

clf = xgb.train(params, d_train, 1000, evals=evallist, early_stopping_rounds=10)
xgb.plot_tree(clf)
plt.rcParams['figure.figsize'] = [50, 10]
plt.show()

To pokazuje problem ze ścieżką:

pip install graphviz

Więc to zadziałało dla mnie:

sudo apt-get install graphviz

Po zainstalowaniu pakietu ( link jeśli nie masz), dodaj ścieżkę do dot.exe jako nową zmienną systemową.

Domyślna ścieżka to:

C: \ Program Files (x86) \ Graphviz2.38 \ bin \ dot.exe

Miałem ten sam problem w Linuksie z Jupyter.

Aby go rozwiązać, dodałem bibliotekę dot do python sys.path

Po pierwsze: sprawdź, czy dotjest zainstalowany,

Następnie:
znajdź jego ścieżkę whereis dot-> / local / notebook / miniconda2 / envs / ik2 / bin / dot

Wreszcie w skrypcie Pythona: sys.path.append („/ local / notebook / miniconda2 / envs / ik2 / bin / dot”)

Najpierw należy użyć pip install, a następnie pobrać inny pakiet ze strony http://www.graphviz.org/Download_windows.php i dodać lokalizację instalacji do ścieżki środowiskowej. Wtedy to działa.

Otrzymałem ten sam komunikat o błędzie w systemie Mac OS (El Capitan), używając IDE PyCharm. Zainstalowałem Graphviz przy użyciu brew, zgodnie z zaleceniami RZK, i zainstalowałem pakiet graphviz python za pomocą PyCharm (mogłem sprawdzić, czy Graphviz został poprawnie zainstalowany, próbując dot -Vw terminalu i otrzymując:dot - graphviz version 2.40.1 (20161225.0304) . Mimo to nadal otrzymywałem komunikat o błędzie podczas próby połączenia się z Graphviz z PyCharm.

Musiałem dodać ścieżkę / usr / local / bin w opcjach PyCharm, zgodnie z zaleceniami w odpowiedzi na to pytanie, aby rozwiązać problem.

Dla użytkowników Linuksa, którzy nie mają uprawnień administratora i dlatego nie mogą używać sudopolecenia, jak sugerowano w innych odpowiedziach ...

Najpierw aktywuj swoje wirtualne środowisko Conda (jeśli chcesz go używać) przez:

source activate virtual-env-name

Następnie zainstaluj graphviz, nawet jeśli już to zrobiłeś za pomocą pip:

conda install graphviz

następnie skopiuj wynik następującego polecenia:

whereis dot

W moim przypadku jego wyjście to:

/home/nader/anaconda2/bin/dot

i dodaj go do zmiennej PATH. Po prostu uruchom poniższe polecenie

nano ~/.bashrc

i dodaj te linie na końcu otwartego pliku:

PATH="/home/username/anaconda2/bin/dot:$PATH"
export PATH

teraz naciśnij Ctrl+, Oa następnie Ctrl+, Xaby zapisać i wyjść.

Problem powinien już zostać rozwiązany.

Uwaga użytkownicy Pycharm: Pycharm nie zawsze widzi zmienną PATH tak samo jak terminal. To rozwiązanie nie działa w przypadku Pycharm i być może innych IDE. Ale możesz to naprawić, dodając ten wiersz kodu:

os.environ["PATH"] += os.pathsep + '/home/nader/anaconda2/bin'

do programu w Pythonie. Nie zapomnij

import os

pierwszy :)

Edycja: Jeśli nie chcesz używać conda, nadal możesz zainstalować Graphviz stąd bez uprawnień roota i dodać folder bin do zmiennej PATH. Nie testowałem tego.

1. zainstaluj pakiet Windows z: https://graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html i pobierz plik msi

Dodaj zmienne środowiskowe 2. Dodaj C: \ Program Files (x86) \ Graphviz2.38 \ bin do ścieżki użytkownika

3. Dodaj C: \ Program Files (x86) \ Graphviz2.38 \ bin \ dot.exe do ścieżki systemowej

4. Zrestartuj swój notatnik Pythona.

To będzie działać.

OS Mojave 10.14., Python 3.6

Używanie pip install graphvizmiało dobrą opinię w terminalu, ale doprowadziło do tego błędu, gdy próbowałem zrobić wykres w notatniku Jupyter. Następnie pobiegłem brew install graphviz, co dało błąd w terminalu. Potem pobiegłem conda install graphvizi wykres zadziałał.

Z komentarza @ Leighton: pip ma tylko problem ze ścieżką tak samo jak twój, a conda otrzymuje tylko błąd importu.

Dodaj graphviz do ścieżki systemowej

1. Windows - Edytuj zmienne środowiskowe systemu.
2. Wybierz zmienne środowiskowe.
3. Wybierz Ścieżka - Nowa
4. Dodaj ścieżkę do graphviz

Np .: C: \ Users \ AppData \ Local \ Continuum \ anaconda3 \ Library \ bin \ graphviz

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + "/Macintosh HD⁩/anaconda3⁩/lib⁩/⁨python3.7⁩/site-packages⁩/sphinx⁩/templates⁩/graphviz"

To rozwiązało dla mnie problem PATH na MAC!

Jeśli nie używasz Conda, ale waniliowego Pythona, działa „brew install graphviz”.

#Write this on anaconda prompt in admin mode
conda install -c anaconda graphviz
conda install -c conda-forge python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/broken python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/cf201901 python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/cf202003 python-graphviz

#check dot -v in window's cmd prompt
C:\WINDOWS\system32>dot -V
dot - graphviz version 2.38.0 (20140413.2041)
(this means graphviz installed successfully)

#Add path to sys and user eve variables
PATH
C:\Anaconda3\pkgs\graphviz-2.38-hfd603c8_2\Library\bin
(search bin folder of graphviz and then copy n paste path in env variables)

#Re-run all cmds in jyupter notebook
#if error occurs (less chances)
#then 
#Restart anaconda and again run all cmds in jyupter notebook
eg.
import graphviz as gp
with open("tree.dot") as f:
    dot_read=f.read()
display(gp.Source(dot_read))

spróbuj wpisać po kolei następujący kod w zachęcie anaconda.

to działało dla mnie.

Źródło: https://anaconda.org/conda-forge/python-graphviz

conda install -c conda-forge python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/broken python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/cf201901 python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/cf202003 python-graphviz 

próba zrobienia tego w pythonie import sys! conda install --yes --prefix {sys.prefix} graphviz import graphviz