Planowanie skryptu R.

Napisałem skrypt R, który pobiera dane z bazy danych, wykonuje na niej kilka operacji i umieszcza dane wyjściowe w nowej bazie danych.

Chciałbym, aby ten skrypt uruchamiał się codziennie o określonej godzinie, ale nie mogę znaleźć żadnego sposobu, aby to zrobić skutecznie.

Czy ktoś może polecić zasób, z którego mógłbym skorzystać, aby rozwiązać ten problem? Uruchamiam ten skrypt na komputerze z systemem Windows.

Właściwie w systemie Windows nie musisz nawet najpierw tworzyć pliku wsadowego, aby użyć harmonogramu .

• Otwórz harmonogram: START -> Wszystkie programy -> Akcesoria -> Narzędzia systemowe -> Harmonogram
• Utwórz nowe zadanie
• na karcie Akcja utwórz nową akcję
• wybierz Start Program
• przejdź do Rscript.exe, który powinien być umieszczony np. tutaj:
  "C: \ Program Files \ R \ R-3.0.2 \ bin \ x64 \ Rscript.exe"
• wprowadź nazwę pliku w polu parametrów
• Wejście ścieżka gdzie skrypt można znaleźć w menu Start w polu
• przejdź do zakładki Wyzwalacze
• utwórz nowy wyzwalacz
• wybierz, że zadanie powinno być wykonywane każdego dnia , miesiąca, ... powtarzane kilka razy lub cokolwiek chcesz

Zakładając, że twój skrypt R znajduje mytest.rsię w D:\mydocuments\, możesz utworzyć plik wsadowy zawierający następujące polecenie:

C:\R\R-2.10.1\bin\Rcmd.exe BATCH D:\mydocuments\mytest.r

Następnie dodaj je jako nowe zadanie do harmonogramu zadań systemu Windows, ustawiając tam warunki wyzwalania.

Możesz również pominąć plik wsadowy. Ustaw C:\R\R-2.10.1\bin\Rcmd.exew polu program/scripttekstowym w harmonogramie zadań i podaj jako Argumentsresztę początkowego polecenia:BATCH D:\mydocuments\mytest.r

Planowanie zadań języka R za pomocą Harmonogramu zadań systemu Windows (opublikowano 11 lutego 2015 r.)

taskcheduleR: Pakiet R do planowania skryptów R za pomocą menedżera zadań systemu Windows (opublikowano 17 marca 2016 r.)

EDYTOWAĆ

Niedawno ponownie przyjąłem użycie plików wsadowych, ponieważ chciałem zminimalizować okno cmd (nie mogłem znaleźć innego sposobu).

W szczególności wypełniam Actionskartę harmonogramu zadań systemu Windows w następujący sposób:

Program/script:

cmd.exe

Add arguments (optional):

/ c start / min D: \ mydocuments \ mytest.bat ^ & exit

Zawartość mytest.bat :

C: \ R \ R-3.5.2 \ bin \ x64 \ Rscript.exe D: \ mydocuments \ mytest.r params

Teraz w RStudio jest wbudowana opcja, aby to zrobić, aby uruchomić harmonogram pierwszej instalacji poniżej pakietów

  install.packages('data.table')
  install.packages('knitr')
  install.packages('miniUI')
  install.packages('shiny')
  install.packages("taskscheduleR", repos = "http://www.datatailor.be/rcube", type = 
  "source")

Po zainstalowaniu przejdź do

**TOOLS -> ADDINS ->BROWSE ADDINS ->taskscheduleR -> Select it and execute it.**

Swoje zadania konfiguruję za pośrednictwem SCHTASKSprogramu. Aby uruchomić skrypty podczas uruchamiania, napisałbyś coś w stylu

SCHTASKS /Create /SC ONSTART /TN MyProgram /TR "R CMD BATCH --vanilla d:\path\to\script.R"

Więcej informacji na ten temat można znaleźć w tej witrynieSCHTASKS . Więcej szczegółów na stronie Microsoft .

Możesz użyć Harmonogramu zadań systemu Windows .

Konfigurowanie harmonogramu zadań

Krok 1) Otwórz harmonogram zadań (Start> wyszukaj Harmonogram zadań)

Krok 2) Kliknij „Akcja”> „Utwórz zadanie”

Krok 3) Wybierz „Uruchom tylko wtedy, gdy użytkownik jest zalogowany”, odznacz „Uruchom z najwyższymi uprawnieniami”, nazwij swoje zadanie, skonfiguruj dla „Windows Vista / Windows Server 2008”

Krok 4) Na karcie „Wyzwalacze” określ, kiedy chcesz uruchomić skrypt

Krok 5) W zakładce „Akcje” wpisz pełną lokalizację pliku Rscript.exe, tj

"C:\Program Files\R\R-3.6.2\bin\Rscript.exe" (include the quotes)

Umieścić nazwę skryptu zz -eoraz source()w argumentach otoczenie go tak:

-e "source('C:/location_of_my_script/test.R')"

Rozwiązywanie problemów ze skryptem Rscript zaplanowanym w Harmonogramie zadań

Po uruchomieniu skryptu za pomocą Harmonogramu zadań trudno jest rozwiązać jakiekolwiek problemy, ponieważ nie pojawiają się żadne komunikaty o błędach.

Można to rozwiązać za pomocą sink()funkcji w języku R, która umożliwia wyprowadzanie wszystkich komunikatów o błędach do określonego pliku. Oto jak możesz to zrobić:

# Set up error log ------------------------------------------------------------
error_log <- file("C:/location_of_my_script/error_log.Rout", open="wt")
sink(error_log, type="message")

try({

# insert your code here

})

Inną rzeczą, którą będziesz musiał zmienić, aby skrypt Rscript działał, jest określenie pełnej ścieżki do wszystkich ścieżek plików w skrypcie.

To nie zadziała w harmonogramie zadań:

source("./functions/import_function.R")

Będziesz musiał określić pełną ścieżkę do wszystkich skryptów, które pozyskujesz w swoim Rscript:

source("C:/location_of_my_script/functions/import_function.R")

Po wykonaniu dowolnej kombinacji tych kroków i wyświetleniu "Argument Batch Ignored"błędu po uruchomieniu programu R.exe, spróbuj tego, zadziałało.

W Harmonogramie zadań systemu Windows:

Zastąp BATCH "C:\Users\desktop\yourscript.R"w polu argumentów

z

CMD BATCH --vanilla --slave "C:\Users\desktop\yourscript.R"