Zapisywanie wykresu grid.arrange () do pliku

Próbuję wykreślić wiele działek za pomocą ggplot2, układając je za pomocą grid.arrange(). Ponieważ udało mi się znaleźć kogoś, kto dokładnie opisałby mój problem, zacytowałem z opisu problemu z linku :

Kiedy używam ggsave()po grid.arrange()tj

grid.arrange(sgcir1,sgcir2,sgcir3,ncol=2,nrow=2)
ggsave("sgcirNIR.jpg")

Nie zapisuję wykresu siatki, ale ostatni indywidualny ggplot. Czy istnieje sposób na zapisanie wyświetlanego wykresu za grid.arrange()pomocą ggsave()lub czegoś podobnego? Inaczej niż starszym sposobem

jpeg("sgcirNIR.jpg")
grid.arrange(sgcir1,sgcir2,sgcir3,ncol=2,nrow=2)
dev.off()

Ten sam link daje poniższe rozwiązanie:

require(grid)
require(gridExtra)
p <- arrangeGrob(qplot(1,1), textGrob("test"))
grid.draw(p) # interactive device
ggsave("saving.pdf", p) # need to specify what to save explicitly

Jednak nie mogę dowiedzieć się, jak użyć ggsave()do zapisania danych wyjściowych grid.arrange()wywołania w poniższym kodzie, który jest pobierany z linku :

library(ggplot2)
library(gridExtra)
dsamp <- diamonds[sample(nrow(diamonds), 1000), ] 

p1 <- qplot(carat, price, data=dsamp, colour=clarity)
p2 <- qplot(carat, price, data=dsamp, colour=clarity, geom="path")

g_legend<-function(a.gplot){
tmp <- ggplot_gtable(ggplot_build(a.gplot))
leg <- which(sapply(tmp$grobs, function(x) x$name) == "guide-box")
legend <- tmp$grobs[[leg]]
return(legend)}

legend <- g_legend(p1)
lwidth <- sum(legend$width)

## using grid.arrange for convenience
## could also manually push viewports
grid.arrange(arrangeGrob(p1 + theme(legend.position="none"),
                                        p2 + theme(legend.position="none"),
                                        main ="this is a title",
                                        left = "This is my global Y-axis title"), legend, 
                     widths=unit.c(unit(1, "npc") - lwidth, lwidth), nrow=1)

# What code to put here to save output of grid.arrange()?

grid.arrangerysuje bezpośrednio na urządzeniu. arrangeGrobz drugiej strony niczego nie rysuje, ale zwraca grob g, do którego możesz przejść ggsave(file="whatever.pdf", g).

Powodem, dla którego działa inaczej niż w przypadku obiektów ggplot, w których domyślnie zapisywany jest ostatni wykres, jeśli nie jest określony, jest to, że ggplot2 niewidocznie śledzi najnowszy wykres i nie sądzę, że grid.arrangepowinien zadzierać z tym licznikiem prywatnym dla pakietu.

Miałem problemy z propozycją babptiste, ale w końcu udało mi się. Oto, czego powinieneś użyć:

 # draw your plots
 plot1 <- ggplot(...) # this specifies your first plot
 plot2 <- ggplot(...) # this specifies your second plot
 plot3 <- ggplot(...) # this specifies your third plot

 #merge all three plots within one grid (and visualize this)
 grid.arrange(plot1, plot2, plot3, nrow=3) #arranges plots within grid

 #save
 g <- arrangeGrob(plot1, plot2, plot3, nrow=3) #generates g
 ggsave(file="whatever.pdf", g) #saves g

To powinno działać dobrze.

Innym prostym sposobem zapisania grid.arrange do pliku pdf jest użycie pdf ():

pdf("filename.pdf", width = 8, height = 12) # Open a new pdf file
grid.arrange(plot1, plot2, plot3, nrow=3) # Write the grid.arrange in the file
dev.off() # Close the file

Pozwala łączyć w aranżację inne rzeczy niż ggplots, np. Tabele ...

Pomyślałem, że warto do tego dodać. Miałem problemy z powyższym, ggsave generował błąd: "wykres powinien być wykresem ggplot2"

Dzięki tej odpowiedzi: Zapisując wykres z ggsave po użyciu ggplot_build i ggplot_gtable mam poprawkę do powyższego kodu.

  # draw your plots
 plot1 <- ggplot(...) # this specifies your first plot
 plot2 <- ggplot(...) # this specifies your second plot
 plot3 <- ggplot(...) # this specifies your third plot

 #merge all three plots within one grid (and visualize this)
 grid.arrange(plot1, plot2, plot3, nrow=3) #arranges plots within grid

 #save
 ggsave <- ggplot2::ggsave; body(ggsave) <- body(ggplot2::ggsave)[-2]

Powyższa linia wymagała naprawy błędu

 g <- arrangeGrob(plot1, plot2, plot3, nrow=3) #generates g
 ggsave(file="whatever.pdf", g) #saves g

Teraz działa na mnie dobrze.

Nie ma potrzeby korzystania z programurangeGrob, można przypisać wynik działania grid.arrange bezpośrednio do wykresu i zapisać go za pomocą ggsave:

p3 <- grid.arrange(p1,p2, nrow = 1)
ggsave("filename.jpg", p3)

Kolejne proste rozwiązanie: zaraz po Twoim grid.arrange()

grid.arrange(plot1, plot2, plot3, nrow=3)

robisz dev.copy()

dev.copy(pdf,"whatever.pdf")
dev.off()