Jeśli naprawdę spadnie zasilanie, lepiej zrobisz z kondensatorem przed regulatorem napięcia (izolowanym diodą, jeśli to konieczne). Dzięki temu napięcie spadnie bardziej, zanim spadnie poniżej specyfikacji dla mikro.
Na przykład (zbieranie liczb z powietrza) załóżmy, że Twoja mikro potrzebuje 5 V, twój regulator dostarcza 4,75 V, a Twoja mikro gwarantuje pracę przy 4,5 V. Przypuśćmy, że zasilasz regulator 9 V z brodawki ściennej, a mikro i inne rzeczy pobierają 50 mA. Załóżmy, że regulator spada na 1,5 V.
Jeśli umieścisz kondensator 1000 uF za regulatorem, czas, w którym będzie on utrzymywał mikro to:
t = 1000uF * (4,75 V - 4,5 V) / 50 mA = 5 ms
Jeśli umieścisz go przed regulatorem, czas, w którym będzie trzymał mikro to:
t = 1000uF * (9 V - 6 V) / 50 mA = 60 ms (około 12x dłużej)
Podejrzewam, że może to być problem z zakłóceniami elektromagnetycznymi powodujący zakłócenia mikroprogramu, chyba że masz wyraźne oznaki, że napięcie faktycznie spada.