Jeśli dobrze zrozumiałem pytanie, nauczyłeś się algorytmu, który dzieli twoje dane na rozłącznych klastrów. Teraz chcesz przypisać predykcję 1 do niektórych podzbiorów klastrów, a 0 do pozostałych. A wśród tych podzbiorów chcesz znaleźć te optymalne dla pareto, tj. Takie, które maksymalizują prawdziwy współczynnik dodatni, biorąc pod uwagę stałą liczbę pozytywnych prognoz (jest to równoważne z ustaleniem PPV). Czy to jest poprawne?N.10
To brzmi jak problem z plecakiem ! Rozmiary klastra to „wagi”, a liczba próbek dodatnich w klastrze to „wartości”, a Ty chcesz wypełnić swój plecak o stałej pojemności możliwie największą wartością.
v a l u ew e i gh tkk0N.
1k - 1p ∈ [ 0 , 1 ]k
Oto przykład python:
import numpy as np
from itertools import combinations, chain
import matplotlib.pyplot as plt
np.random.seed(1)
n_obs = 1000
n = 10
# generate clusters as indices of tree leaves
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier
from sklearn.datasets import make_classification
from sklearn.model_selection import cross_val_predict
X, target = make_classification(n_samples=n_obs)
raw_clusters = DecisionTreeClassifier(max_leaf_nodes=n).fit(X, target).apply(X)
recoding = {x:i for i, x in enumerate(np.unique(raw_clusters))}
clusters = np.array([recoding[x] for x in raw_clusters])
def powerset(xs):
""" Get set of all subsets """
return chain.from_iterable(combinations(xs,n) for n in range(len(xs)+1))
def subset_to_metrics(subset, clusters, target):
""" Calculate TPR and FPR for a subset of clusters """
prediction = np.zeros(n_obs)
prediction[np.isin(clusters, subset)] = 1
tpr = sum(target*prediction) / sum(target) if sum(target) > 0 else 1
fpr = sum((1-target)*prediction) / sum(1-target) if sum(1-target) > 0 else 1
return fpr, tpr
# evaluate all subsets
all_tpr = []
all_fpr = []
for subset in powerset(range(n)):
tpr, fpr = subset_to_metrics(subset, clusters, target)
all_tpr.append(tpr)
all_fpr.append(fpr)
# evaluate only the upper bound, using knapsack greedy solution
ratios = [target[clusters==i].mean() for i in range(n)]
order = np.argsort(ratios)[::-1]
new_tpr = []
new_fpr = []
for i in range(n):
subset = order[0:(i+1)]
tpr, fpr = subset_to_metrics(subset, clusters, target)
new_tpr.append(tpr)
new_fpr.append(fpr)
plt.figure(figsize=(5,5))
plt.scatter(all_tpr, all_fpr, s=3)
plt.plot(new_tpr, new_fpr, c='red', lw=1)
plt.xlabel('TPR')
plt.ylabel('FPR')
plt.title('All and Pareto-optimal subsets')
plt.show();
Ten kod narysuje dla Ciebie ładne zdjęcie:
2)10
A teraz odrobina soli: wcale nie musiałeś przejmować się podzbiorami ! To, co zrobiłem, to posortowanie liści drzew według ułamka próbek pozytywnych w każdym z nich. Ale otrzymałem właśnie krzywą ROC do probabilistycznego przewidywania drzewa. Oznacza to, że nie można przewyższyć drzewa, wybierając ręcznie liście na podstawie częstotliwości docelowych w zestawie treningowym.
Możesz się zrelaksować i nadal używać zwykłych prognoz probabilistycznych :)