Peter Shor pokazał, że dwa z najważniejszych problemów pośrednich NP, faktoring i dyskretny log, są w BQP. Natomiast najbardziej znany algorytm kwantowy dla SAT (poszukiwanie Grovera) zapewnia jedynie kwadratową poprawę w porównaniu z klasycznym algorytmem, co sugeruje, że problemy z całkowitą NP są wciąż trudne do rozwiązania na komputerach kwantowych. Jak wskazują Arora i Barak, istnieje również problem w BQP, który nie jest znany z NP, co prowadzi do przypuszczenia, że obie klasy są nieporównywalne.
Czy jest jakaś wiedza / przypuszczenie, dlaczego te pośrednie problemy NP występują w BQP, ale dlaczego SAT (o ile wiemy) nie jest? Czy inne problemy NP-pośrednie podążają za tym trendem? W szczególności, czy izomorfizm grafów w BQP? (ten nie działa dobrze w Google).